PRJNA1265679：FTO升高通过调控巨噬细胞炎症表型缓解脓毒症诱导的急性肾损伤 [RNA-Seq]
该数据集来自 NCBI BioProject，编号 PRJNA1265679，主题为 FTO 升高通过调控巨噬细胞炎症表型缓解脓毒症诱导的急性肾损伤，采用 RNA-Seq 技术，属于转录组或基因表达数据
![PRJNA1265679: Elevated FTO alleviates sepsis-induced acute kidney injury by regulating macrophage inflammatory phenotypes [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/120383.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1265679：FTO升高通过调控巨噬细胞炎症表型缓解脓毒症诱导的急性肾损伤 [RNA-Seq]
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目，编号 PRJNA1265679，英文标题为 “Elevated FTO alleviates sepsis-induced acute kidney injury by regulating macrophage inflammatory phenotypes [RNA-Seq]”。其研究主题聚焦于 FTO 表达升高通过调控巨噬细胞炎症表型，从而缓解脓毒症诱导的急性肾损伤。项目采用 RNA-Seq 技术，属于转录组或基因表达数据范畴。在 NCBI BioProject 的框架下，该记录汇集了与这一研究计划相关的生物数据，并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症分类，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。整体而言，该数据集可用于了解 FTO 在脓毒症相关急性肾损伤及巨噬细胞炎症表型调控中的转录组层面研究信息。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 PRJNA1265679。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议汇集生物数据的记录，这些数据可来自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一位置，以查找该项目所产生的不同数据类型之间的链接。该项目的标题表明其研究关注 FTO 升高在脓毒症诱导的急性肾损伤中的作用，并涉及巨噬细胞炎症表型的调控。研究采用 RNA-Seq 技术，因此属于转录组或基因表达研究范畴。本站将该数据集分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。关于该研究的具体实验背景、立项机构、研究团队及资助信息，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 RNA-Seq 数据，主题标签明确为 Transcriptome or Gene expression。项目标题显示其研究内容涉及 FTO 升高、脓毒症诱导的急性肾损伤以及巨噬细胞炎症表型调控之间的关系。作为 BioProject 记录，该数据集提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接，便于用户从单一入口获取相关生物数据。数据的具体样本数量、测序平台、读长、覆盖度、基因表达矩阵、差异表达结果、注释文件及原始数据文件等信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 BioProject - NCBI。项目编号为 PRJNA1265679，属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录。BioProject 记录本身是围绕单一研究计划或倡议汇集生物数据的集合，可来自单一组织或联盟。该数据集通过 NCBI BioProject 平台对外提供访问入口，并链接至项目相关的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、组织来源、伦理审批信息、测序机构及具体实验流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关研究场景，尤其是围绕 FTO 表达变化、脓毒症诱导的急性肾损伤以及巨噬细胞炎症表型调控的研究方向。由于本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症分类，该数据集也可能为关注代谢疾病与炎症、肾脏损伤交叉领域的研究人员提供参考。用户可通过 BioProject 记录查找该项目产生的不同数据类型，用于数据挖掘、比较分析或二次研究。关于该数据集在具体疾病机制、生物标志物发现、药物靶点筛选或临床转化中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 PRJNA1265679 的记录，并利用该记录提供的链接查找项目所生成的不同数据类型。BioProject 记录的设计目的是为用户提供一个统一位置，以发现与单一研究计划相关的多种数据。因此，使用该数据集时，可先通过 BioProject 入口了解项目概况，再根据链接跳转至相应的数据资源。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具、参数设置及重分析步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 记录，其描述说明 BioProject 是围绕单一研究计划或倡议汇集生物数据的集合，并提供指向不同数据类型的链接。该记录的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其数据属于转录组或基因表达范畴。关于数据质量评估指标、测序深度、重复数、批次效应、数据完整性、潜在偏差及使用限制等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 BioProject - NCBI，项目编号为 PRJNA1265679。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用权限、数据共享政策及版权信息，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1265679
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
近期研究已将N6-甲基腺苷（m6A）的失调与脓毒症诱导的急性肾损伤（SAKI）联系起来，凸显了控制过度促炎细胞因子产生及后续器官功能障碍所面临的持续挑战。在本研究中，我们分析了数据集GSE32707和GSE69063，发现肥胖相关蛋白（FTO）是脓毒症患者外周血样本转录组中唯一在m6A相关蛋白中呈现显著下调的基因。我们进一步证明，接受盲肠结扎穿刺（CLP）的脓毒症小鼠在肾组织和腹腔巨噬细胞（PMs）中均表现出m6A修饰增加和FTO表达降低。我们的研究结果揭示，FTO水平升高与脓毒症期间死亡率和肾损伤降低相关，并且在脂多糖（LPS）刺激的巨噬细胞中上调FTO可导致促炎细胞因子产生减少。
在机制上，通过对巨噬细胞的多组学分析，我们发现了一种新机制，涉及基质金属蛋白酶9（MMP-9）作为FTO的直接靶点，FTO对其翻译效率具有正向影响。此外，体内和体外数据均证实，MMP-9水平降低对减轻炎症反应和缓解肾损伤产生了不利影响。总体而言，我们的研究结果强调了FTO/m6A/MMP-9轴在调控促炎分泌中的关键作用，并增进了我们对SAKI进展过程中转录组图景的理解。总体设计：对野生型RAW267.4细胞及其过表达FTO的细胞进行RNA-seq，分别在有或无LPS刺激条件下（Ctrl、LPS和FTO+LPS）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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