HMMR缺失在神经母细胞瘤细胞中的磷酸化蛋白质组学研究

该数据集是一个磷酸化蛋白质组学数据集，包含从KELLY神经母细胞瘤细胞中提取的磷酸化肽段的质谱分析数据，数据模态为蛋白质组学质谱数据。研究通过比较野生型与CRISPR/Cas9敲除HMMR基因的细胞，分析磷酸化水平的差异，主要应用于探索HMMR在神经母细胞瘤细胞信号传导中的功能角色，为肿瘤生物学和靶向治疗研究提供分子层面的见解。

Mendeley Data

2025-01-01 更新

Phosphoproteomic study of HMMR loss in neuroblastoma cells

基本信息

大小

0.014113159 GB

创建/更新时间

2025-01-01

版本

资源简介

HMMR缺失在神经母细胞瘤细胞中的磷酸化蛋白质组学研究

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Phosphoproteomic study of HMMR loss in neuroblastoma cells》。源站首次发布：2026-03-18。

【数据内容】

源站原始描述：This is processed dataset from a mass spectrometric analysis of phosphopeptides extracted from KELLY neuroblastoma cells. It compares peptides from cells with wild type HMMR genes and cells where the HMMR is inactivated using CRISPR/Cas9. The analysis aimed to understand how intracellular signaling was altered after the removal of HMMR to understand the potential functional role of HMMR in these tumour cells. the signalling networks in which HMMR was involved in these tumour cells. The are four…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 14.11 MB。数据集 DOI：10.17632/6wr2tj8wr9.2。

【获取与许可】

源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/6wr2tj8wr9

原始链接

https://data.mendeley.com/datasets/6wr2tj8wr9/1

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://data.mendeley.com/datasets/6wr2tj8wr9/1

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个经过处理的磷酸化蛋白质组学数据集，来源于对KELLY神经母细胞瘤细胞中提取的磷酸化肽段进行的质谱分析。研究比较了野生型HMMR基因细胞与通过CRISPR/Cas9技术敲除HMMR基因的细胞之间的肽段差异，旨在揭示HMMR缺失后细胞内信号通路的改变，以理解HMMR在肿瘤细胞中的潜在功能角色。数据集包含四种细胞类型：KELLY（亲本）、KC17（经CRISPR/Cas9处理但HMMR基因完整）、KA5和KA14（经CRISPR/Cas9处理且HMMR发生移码突变，不表达蛋白）。分析重点关注KA5和KA14中磷酸化水平与KELLY和KC17相比有显著差异的肽段。数据文件包含热图、激酶底物富集分析（KSEA）结果以及详细的单个肽段数据，处理方法遵循Thompson, E. M., et al. (2022) 在FEBS Open Bio中发表的研究。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))