HMMR缺失在神经母细胞瘤细胞中的磷酸化蛋白质组学研究

该数据集是一个磷酸化蛋白质组学数据集,包含从KELLY神经母细胞瘤细胞中提取的磷酸化肽段的质谱分析数据,数据模态为蛋白质组学质谱数据。研究通过比较野生型与CRISPR/Cas9敲除HMMR基因的细胞,分析磷酸化水平的差异,主要应用于探索HMMR在神经母细胞瘤细胞信号传导中的功能角色,为肿瘤生物学和靶向治疗研究提供分子层面的见解。

Mendeley Data
2025-01-01 更新
创建时间2025-01-01
更新时间2025-01-01
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https://data.mendeley.com/datasets/6wr2tj8wr9/1

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资源简介

该数据集是一个经过处理的磷酸化蛋白质组学数据集,来源于对KELLY神经母细胞瘤细胞中提取的磷酸化肽段进行的质谱分析。研究比较了野生型HMMR基因细胞与通过CRISPR/Cas9技术敲除HMMR基因的细胞之间的肽段差异,旨在揭示HMMR缺失后细胞内信号通路的改变,以理解HMMR在肿瘤细胞中的潜在功能角色。数据集包含四种细胞类型:KELLY(亲本)、KC17(经CRISPR/Cas9处理但HMMR基因完整)、KA5和KA14(经CRISPR/Cas9处理且HMMR发生移码突变,不表达蛋白)。分析重点关注KA5和KA14中磷酸化水平与KELLY和KC17相比有显著差异的肽段。数据文件包含热图、激酶底物富集分析(KSEA)结果以及详细的单个肽段数据,处理方法遵循Thompson, E. M., et al. (2022) 在FEBS Open Bio中发表的研究。

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影像Phosphoproteomic study of HMMR loss in neuroblastoma cells