GenX相关分子特征与睾丸衰老及男性不育的多组学整合分析数据集
该数据集整合了人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据与男性不育的转录组数据,通过多组学分析方法识别出SOD1、XRCC5、FOXO3和POLB四个关键基因作为男性不育的潜在诊断标志物,并利用实验验证了这些基因在GenX暴露下的表达变化,主要用于研究环境毒物诱导的生殖毒性机制及男性不育的分子诊断。
https://figshare.com/articles/dataset/GenX-associated_molecular_signatures_overlap_with_testicular_aging_and_male_infertility_a_multi-omics_integration_analysis/31568890
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资源简介
该数据集聚焦于短链全氟和多氟烷基物质(PFAS)替代物GenX(HFPO-DA)对睾丸的毒性作用,通过整合多组学数据探究其与睾丸衰老及男性不育的分子关联。数据集整合了人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据(GSE254315)以及男性不育的转录组数据集(GSE45885/GSE45887),通过LASSO回归和支持向量机递归特征消除等方法,识别出SOD1、XRCC5、FOXO3和POLB四个关键基因作为男性不育的潜在诊断标志物。研究进一步通过RT-qPCR在GenX暴露的大鼠睾丸组织中验证了这些基因的表达变化,并利用分子对接确认了GenX与蛋白的相互作用。该数据集主要用于研究环境毒物(GenX)诱导的生殖毒性机制,涉及氧化应激、基因组维护和细胞衰老等通路,为男性不育的分子诊断和生殖毒理学研究提供了数据支持。
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