生殖轴对应激的性别偏向转录组响应

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A31134cc0b8a5f7961388f1013403b8bb4608a9dfef1277e060591e0061e7b91d

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

应激是许多物种（包括鸟类、啮齿动物和人类）生殖功能障碍的已知原因，尽管雌雄两性的反应可能不同。研究应激如何影响生殖的一种有力方法是，考察其对调节生殖至关重要的生物系统——下丘脑-垂体-性腺（HPG）轴的影响。通常的做法是观察应激源如何影响血液中循环的糖皮质激素（如皮质醇或皮质酮）的量，以及它们与少数已知的HPG产生的生殖激素（如睾酮和雌二醇）之间的关系。迄今为止，我们尚未全面了解应激如何影响HPG轴的所有基因组活动，以及这种影响在雌雄之间可能存在何种差异。我们采用了一种高度重复且性别平衡的实验方法，来检验雄性和雌性岩鸽（Columba livia）在转录组水平上如何对应激作出反应。雌性表现出增加的基因组反应……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。