骨髓培养中分化嗜酸性粒细胞的表达谱预测MicroRNA与其靶mRNA之间的功能联系

该数据集包含骨髓培养中嗜酸性粒细胞分化过程中的miRNA表达谱数据,通过生物信息学分析预测了miRNA与靶mRNA之间的功能联系,涉及68个差异表达miRNA和348个潜在靶转录本,数据模态为基因表达数据(非编码RNA与mRNA),主要用于研究嗜酸性粒细胞分化的调控网络、miRNA在免疫细胞发育中的作用机制,以及高嗜酸性粒细胞综合征等疾病的分子基础。

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2016-01-18 更新
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cell biologyCellular typesAnimal cellsImmune cellsdevelopmental biologyCell differentiationMolecular developmentimmunologyClinical immunologyallergiesImmune responseinflammation
Expression Profiling of Differentiating Eosinophils in Bone Marrow Cultures Predicts Functional Links between MicroRNAs and Their Target mRNAs

基本信息

大小
0.000686324 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-01-18
版本
v1

资源简介

骨髓培养中分化嗜酸性粒细胞的表达谱预测MicroRNA与其靶mRNA之间的功能联系

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Expression Profiling of Differentiating Eosinophils in Bone Marrow Cultures Predicts Functional Links between MicroRNAs and Their Target mRNAs》。配套论文《Expression Profiling of Differentiating Eosinophils in Bone Marrow Cultures Predicts Functional Links between MicroRNAs and Their Target mRNAs》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0097537。源站首次发布:2014-05-13。

【数据内容】

源站原始描述:Background MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that regulate complex transcriptional networks underpin immune responses. However, little is known about the specific miRNA networks that control differentiation of specific leukocyte subsets. In this study, we profiled miRNA expression during differentiation of eosinophils from bone marrow (BM) progenitors (bmEos), and correlated expression with potential mRNA targets involved in crucial regulatory functions. Profiling was performed on who…

【数据结构与技术规格】

文件数 6 个,合计 686.32 KB。Figure_S1.tif:image/tiff,217.03 KB。Figure_S2.tif:image/tiff,137.91 KB。Table_S1.doc:application/msword,56.32 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0097537。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:cell biology、Cellular types、Animal cells、Immune cells、developmental biology、Cell differentiation、Molecular development、immunology、Clinical immunology、allergies。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Expression_Profiling_of_Differentiating_Eosinophils_in_Bone_Marrow_Cultures_Predicts_Functional_Links_between_MicroRNAs_and_Their_Target_mRNAs_/1024778

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Yang, Ming; Eyers, Fiona; Xiang, Yang; Guo, Man; Young, Ian G.; F. Rosenberg, Helene; et al. (2016). Expression Profiling of Differentiating Eosinophils in Bone Marrow Cultures Predicts Functional Links between MicroRNAs and Their Target mRNAs. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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数据说明

该数据集是一个基因表达谱数据集,主要研究骨髓微环境中嗜酸性粒细胞分化过程中microRNA(miRNA)的表达动态及其与靶mRNA的调控关系。数据集包含从骨髓培养中获得的68个表达变化显著的miRNA表达谱数据,通过TargetScan、MeSH、miRanda和Ingenuity Pathways Analysis(IPA)等生物信息学工具,预测了348个涉及30条经典通路的转录本作为潜在靶点,并识别了与IL-5Rα、CCR3、GATA-1/2、PU.1、C/EBPε以及TLR4/13等关键因子表达相关的特异性miRNA。数据来源于全骨髓培养体系,通过高通量测序或芯片技术构建,主要用于研究嗜酸性粒细胞分化调控机制、miRNA-mRNA互作网络,以及相关免疫疾病(如高嗜酸性粒细胞综合征)的分子基础。

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