非酒精性脂肪肝病关键基因与免疫浸润的识别：生物信息学分析
该数据集包含来自GEO数据库的GSE89632基因表达数据，涵盖63个样本（包括NAFLD患者和健康对照），通过生物信息学方法分析差异表达基因、免疫细胞浸润及蛋白质-蛋白质相互作用网络，识别出IL-6、MYC等关键基因，并揭示与NAFLD相关的免疫微环境变化，主要用于非酒精性脂肪肝病的分子机制研究、免疫学分析及潜在治疗靶点探索。
创建时间2024-05-09
更新时间2025-03-17
原始链接
https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=OA_16b190c1cdb74bff85435202caf3f386
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资源简介
该数据集基于GEO数据库中的GSE89632数据，旨在通过生物信息学方法分析非酒精性脂肪肝病（NAFLD）与正常肝组织之间的差异表达基因和免疫浸润特征，以探索其相关分子机制。数据集包含63个样本，其中39例为NAFLD（包括20例单纯性脂肪肝和19例非酒精性脂肪性肝炎），24例为健康对照。研究使用R语言的“limma”包筛选差异表达基因，并通过DAVID数据库对前375个差异表达基因进行GO和KEGG富集分析，同时利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，使用Cytoscape识别关键基因（如IL-6、MYC、IL-1β、JUN），并应用“CIBERSORT”包检测NAFLD中的免疫细胞浸润情况。该数据集主要应用于NAFLD的病理机制研究、免疫微环境分析以及潜在生物标志物和药物靶点的发现。
提供机构：Xiangying.Meng; Jiayi.Cui; Wenting.Shang; Peipei.Zhou
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