大鼠阴茎海绵体全转录组分析及circRNA-miRNA-mRNA网络构建以研究神经损伤性勃起功能障碍发病机制
该数据集包含大鼠阴茎海绵体组织的全转录组测序数据，涉及circRNA、miRNA和mRNA三种分子模态，通过构建ceRNA调控网络并分析能量代谢相关通路，旨在研究神经损伤性勃起功能障碍的发病机制，为理解ED的分子基础及寻找潜在治疗靶点提供关键实验依据。
基本信息
资源简介
大鼠阴茎海绵体全转录组分析及circRNA-miRNA-mRNA网络构建以研究神经损伤性勃起功能障碍发病机制
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Whole-transcriptome analysis of rat cavernosum and identification of circRNA-miRNA-mRNA networks to investigate nerve injury erectile dysfunction pathogenesis》。配套论文《Whole-transcriptome analysis of rat cavernosum and identification of circRNA-miRNA-mRNA networks to investigate nerve injury erectile dysfunction pathogenesis》发表于 Bioengineered（2021），DOI：10.1080/21655979.2021.1973863。项目资助方：This work was supported by National Natural Science Foundation of China(No. 81804092,82004360,82174376,82074433), Zhejiang Provincial Natural Science Foundation of China(No.GF20H270004, LY19H270011) and Zhejiang Provincial Key Research Project of Traditional Chinese Medicine,(No.2018ZY007).。源站首次发布：2021-12-31。
【数据内容】
源站原始描述：There is growing evidence that circular RNAs (circRNAs) play a vital role in many kinds of diseases, including erectile dysfunction (ED). Nevertheless, the role of circRNAs in cavernous nerve-damaging ED (CNI-ED) is unknown. Here, we aimed to discover novel circRNAs, probed their potential role in the CNI-ED, and construct a ceRNA network of circRNAs. Twelve male Sprague Dawley rats were randomly divided into 2 groups by us: bilateral cavernous nerve crush (BCNC) and control groups. Four weeks a…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 431.47 KB。Figure supplement.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，122.73 KB。Supplementary volcanic map.png：image/png，308.74 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.16545449.v3。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：Erectile dysfunction、circular RNA、ceRNA network、bioinformatics analysis、energy metabolism。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Whole-Transcriptome_Analysis_of_Rat_cavernosum_and_Identification_of_circRNA-miRNA-mRNA_Networks_to_Investigate_Nerve_Injury_Erectile_Dysfunction_Pathogenesis/16545449
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Whole-transcriptome analysis of rat cavernosum and identification of circRNA-miRNA-mRNA networks to investigate nerve injury erectile dysfunction pathogenesis. Taylor & Francis. Huang, Jie; Ma, Jianxiong; Wang, Jie; Ma, Ke; Zhou, Kang; Huang, Wenjie; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-02-15，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集是一个针对神经损伤性勃起功能障碍（CNI-ED）的分子机制研究数据集，通过大鼠模型构建。数据集包含12只雄性Sprague Dawley大鼠的海绵体组织，分为双侧海绵体神经损伤组和对照组，利用高通量全转录组测序技术获取了circRNA、miRNA和mRNA的表达谱。数据内容涵盖4,587个差异表达的circRNA、762个miRNA和21,661个mRNA，并进一步通过RT-qPCR验证了前20个差异circRNA。基于这些数据，研究者构建了包含10个circRNA、6个miRNA和227个mRNA的ceRNA调控网络，并进行了GO和KEGG富集分析，揭示了circRNA可能通过调控细胞能量代谢过程参与CNI-ED的发生。该数据集主要用于研究勃起功能障碍的分子通路，特别是circRNA在神经损伤中的作用，为ED的机制探索和治疗靶点发现提供了数据支持。
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