大鼠海绵体全转录组分析及 circRNA-miRNA-mRNA 网络鉴定以研究神经损伤性勃起功能障碍的发病机制

该数据集包含大鼠阴茎海绵体组织的全转录组测序数据,涵盖 circRNA、miRNA 和 mRNA 三种分子模态的表达谱,通过实验构建了 ceRNA 调控网络并进行了功能富集分析,主要用于研究神经损伤性勃起功能障碍的分子发病机制,探索非编码 RNA 在能量代谢调控中的潜在作用,为疾病治疗提供新的靶点。

Ma, Ke; Lv, Bodong; Wang, Jie; Huang, Wenjie; Zhao, Fan; Ma, Jianxiong; Zhou, Kang; Huang, Jie; Hu, Qing
Taylor & Francis Group
2024-02-15 更新
勃起功能障碍分子机制circRNA调控网络
创建时间2021-08-31
更新时间2024-02-15
原始链接

https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Whole-Transcriptome_Analysis_of_Rat_cavernosum_and_Identification_of_circRNA-miRNA-mRNA_Networks_to_Investigate_Nerve_Injury_Erectile_Dysfunction_Pathogenesis/16545449/1

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资源简介

该数据集是一项针对大鼠神经损伤性勃起功能障碍(CNI-ED)的分子机制研究数据集。数据集包含通过高通量全转录组测序获取的大鼠阴茎海绵体组织数据,具体涉及 circRNA、miRNA 和 mRNA 的表达谱。数据来源为实验研究,将12只雄性 Sprague Dawley 大鼠随机分为双侧海绵体神经挤压(BCNC)组和对照组,术后4周采集组织进行测序。分析内容包括差异表达的 circRNA、miRNA 和 mRNA 的鉴定,并通过 RT-qPCR 验证了20个显著差异表达的 circRNA。进一步构建了 ceRNA 调控网络,包含10个 circRNA、6个 miRNA 和 227个 mRNA,并进行了 GO 和 KEGG 富集分析,揭示了这些 circRNA 可能通过调控细胞能量代谢过程参与 CNI-ED 的发生。该数据集主要用于研究勃起功能障碍的分子机制、非编码 RNA 调控网络以及潜在的治疗靶点。

提供机构:Ma, Ke; Lv, Bodong; Wang, Jie; Huang, Wenjie; Zhao, Fan; Ma, Jianxiong; Zhou, Kang; Huang, Jie; Hu, Qing

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影像Whole-Transcriptome Analysis of Rat Cavernosum and Identification of circRNA-miRNA-mRNA Networks to Investigate Nerve Injury Erectile Dysfunction Pathogenesis