老龄雄性大鼠砷暴露戒断与粪菌移植的16S rRNA微生物组处理数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23387410

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 3.2 MB。

数据说明

该数据集包含来自研究“粪菌移植与停砷对长期暴露于亚砷酸钠的老年雄性后代大鼠葡萄糖稳态的影响”的经处理16S rRNA V3–V4微生物组数据及相关样本/分组元数据。数据集包括九个组共54个终点样本标签，每组六个样本标签：C、L、LF、H、HF、SLC、SLF、SHC和SHF。相关手稿描述了PND550终点队列中的雄性Sprague-Dawley大鼠、名义亚砷酸钠浓度0、30或100 mg/L，以及为期12周的停砷/粪菌移植干预。实验描述源自手稿；原始动物标识符和确切采集日期不可用。该档案包含29个文件，包括一个21,639个特征的BIOM表及相应文本表、代表性序列、系统发育树、属水平和门水平的计数与相对丰度表、α多样性指标、归档的供应商特征水平Bray–Curtis距离矩阵、测序QC摘要，以及记录样本分组、来源和已知局限性的元数据。

分类学注释中的不一致之处，以及所报告的质控计数与最终特征计数之间的差异，均已记录在元数据中。本数据存档提供的是保留的处理后微生物组数据集，并不构成所有手稿终点所需的完整原始数据集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。