Diosmetin通过磷脂酰乙醇胺代谢控制阻断Ⅰ型干扰素信号数据集2

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 990566),主题为转录组或基因表达,属于内分泌、营养和代谢疾病及其他类别

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时间序列Transcriptome or Gene expression
PRJNA990566: Diosmetin blocks type Ⅰ interferon  signaling by metabolic control of phosphatidylethanolamine [dataset 2]

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

Diosmetin通过磷脂酰乙醇胺代谢控制阻断Ⅰ型干扰素信号数据集2

PRJNA990566 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学研究项目数据集,其完整英文名称为“Diosmetin blocks type Ⅰ interferon signaling by metabolic control of phosphatidylethanolamine [dataset 2]”。该数据集围绕转录组或基因表达这一主题组织,在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病及其他类别。作为 BioProject 体系中的一份记录,它汇聚了与单一研究计划相关的生物学数据,便于使用者在同一入口下查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 990566,其标题在源站以“Diosmetin blocks type Ⅰ interferon signaling by m...”的形式呈现。整体而言,这是一个以基因表达为观测层面的研究项目记录,服务于对相关生物学过程的数据检索与再利用。

【数据集背景】

该数据集依托 NCBI BioProject 体系建立。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议组织起来的生物学数据集合,其来源可以是单个机构,也可以是一个联合体。BioProject 记录的核心价值在于为用户提供一个统一的查找位置,使其能够获取同一项目下产生的多种不同类型的数据。本数据集的英文名称指向一项关于 Diosmetin 阻断 Ⅰ 型干扰素信号传导、并涉及磷脂酰乙醇胺代谢调控的研究,属于该研究计划中的第二份数据集。在学科分类上,它被归入内分泌、营养和代谢疾病及其他类别,主题标签为转录组或基因表达,说明该项目的数据产出与基因表达谱的测定和分析密切相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,即转录组或基因表达。这表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。除这一主题标签外,源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件格式、基因列表或表达量矩阵等更具体的内容描述。数据集名称中提及 Diosmetin、Ⅰ 型干扰素信号传导以及磷脂酰乙醇胺的代谢调控,这些构成了该项目的研究语境,但具体的数据内容细节源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 990566,属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录。源站描述指出,BioProject 记录来自单一组织或联合体,并围绕单一研究计划汇集数据。关于该项目的具体采集方法、实验设计、样本来源、采集时间与地点等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其转录组或基因表达的主题属性,该数据集适用于与基因表达分析相关的研究场景,例如对特定处理条件下转录水平变化的检索与比较。同时,由于其分类归属内分泌、营养和代谢疾病及其他,也可供该领域的研究者在数据检索、项目溯源或二次分析时参考。数据集名称所指向的 Diosmetin 与 Ⅰ 型干扰素信号传导、磷脂酰乙醇胺代谢调控之间的关系,可能为相关机制研究提供数据线索。除上述基于主题标签与分类的通用适用方向外,源站未提供关于该数据集具体适用场景的说明。

【使用方法】

该数据集托管于 NCBI BioProject,可通过项目编号 990566 在 ncbi.nlm.nih.gov 上进行检索与访问。BioProject 记录的设计目的即在于让用户通过单一入口找到该项目关联的多种数据类型,因此使用者可借助该记录定位并获取项目所生成的数据。关于数据下载方式、文件组织格式、分析流程或配套工具等具体使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于机构维护的公共生物数据资源。源站未提供关于该数据集质量控制指标、数据完整性评估、版本更新情况或已知技术偏差的具体信息。使用者应注意,本数据集的描述信息以源站记录为准,源站未提供的细节无法在此确认。此外,该数据集为某一研究计划中的第二份数据集,其与其他关联数据集之间的关系,源站未提供进一步说明。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 990566。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应自行查阅 NCBI BioProject 及项目相关页面以获取准确的引用与许可信息。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA990566

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

I型干扰素(IFN-I)在系统性红斑狼疮(SLE)及许多其他自身免疫性疾病的发生发展中至关重要。为探究IFN-I信号通路的代谢调控机制,我们对小分子化合物库进行了高通量筛选,并鉴定出香叶木素(diosmetin)是一种可有效阻断IFN-I信号的化合物。香叶木素能够改善IFNα加速的NZB/NZW F1狼疮模型及降植烷诱导的小鼠狼疮模型中的狼疮样自身免疫表型。值得注意的是,香叶木素可通过降低CYP1B1的表达,阻断狼疮患者PBMCs中过度激活的IFN-I信号通路。我们的研究揭示了IFN-I信号的一种新型脂质代谢调控机制,并为IFN-I信号通路过度激活的自身免疫性疾病提供了一个有效的替代治疗靶点。总体设计:研究香叶木素在NZB/NZW F1小鼠肾脏组织中I型干扰素信号传导中的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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