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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA990565：Diosmetin 通过磷脂酰乙醇胺代谢控制阻断 Ⅰ 型干扰素 1 信号 [数据集 1]

该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项转录组或基因表达研究项目，编号 990565，英文名称为“PRJNA990565: Diosmetin blocks type Ⅰ interferon 1 signaling by metabolic control of phosphatidylethanolamine [dataset 1]”。从名称可以看出，该项目围绕 Diosmetin 这一天然黄酮类化合物展开，研究其通过调控磷脂酰乙醇胺代谢来阻断 Ⅰ 型干扰素 1 信号通路的机制。项目归类于内分泌、营养和代谢疾病及其他相关方向，数据来源为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据集合，旨在将同一研究计划下产生的多种数据类型集中呈现，便于用户在一个入口处获取相关数据链接。该数据集的主题标签为转录组或基因表达，说明其核心数据形式为基因表达层面的高通量测序信息，适合用于探索 Diosmetin 处理条件下转录组变化及其与磷脂酰乙醇胺代谢和干扰素信号之间的关联。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 990565。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式，用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据，这些计划可能来自一个机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本站将该数据集归类于内分泌、营养和代谢疾病及其他类别，提示其研究内容可能与代谢调控和疾病机制相关。项目标题明确指出研究主题为 Diosmetin 通过磷脂酰乙醇胺的代谢控制来阻断 Ⅰ 型干扰素 1 信号，因此该数据集属于基础机制研究范畴，涉及天然产物、脂质代谢与免疫信号转导的交叉领域。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容主要涉及转录组或基因表达信息。这意味着项目可能包含 RNA 测序或其他基因表达检测手段产生的数据，用于分析在 Diosmetin 处理或磷脂酰乙醇胺代谢干预条件下，细胞内基因表达谱的变化。由于项目标题聚焦于 Ⅰ 型干扰素 1 信号通路，数据内容可能涵盖与该通路相关的基因表达改变，以及磷脂酰乙醇胺代谢相关基因的表达情况。但除主题标签外，源站未提供更具体的样本数量、测序平台、数据文件格式或分析结果等细节。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库。BioProject 记录本身并不直接包含所有原始数据文件，而是提供指向不同数据类型生成项目的链接。该项目的英文名称中包含“[dataset 1]”字样，可能表示这是同一研究计划下的第一个数据集。源站描述仅对 BioProject 的性质作了通用说明，未提供该具体项目的采集方法、实验设计、样本来源或测序策略等信息，因此这些内容源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是涉及 Diosmetin 处理、磷脂酰乙醇胺代谢调控以及 Ⅰ 型干扰素 1 信号通路的研究。研究人员可以利用该数据集探索天然产物如何通过代谢途径影响免疫信号，或进行差异表达分析、通路富集分析等。此外，由于本站分类将其归入内分泌、营养和代谢疾病及其他，该数据集也可能对代谢性疾病与免疫调节交叉领域的研究具有参考价值。但具体适用性需结合项目实际数据内容判断，源站未提供详细说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问，用户可依据项目编号 990565 在 ncbi.nlm.nih.gov 上检索并获取相关数据链接。BioProject 记录通常提供指向 SRA、GEO 或其他 NCBI 资源的链接，用户可根据链接进一步下载原始测序数据或表达矩阵。由于源站未提供该项目的具体使用指南、分析流程或推荐工具，因此详细使用方法源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库记录，其数据质量依赖于原始研究项目的实验设计和数据提交规范。然而，源站未提供该项目的质量控制指标、数据完整性说明或已知限制。此外，由于项目标题和主题标签仅提供概括性信息，用户在使用时需注意数据可能仅覆盖转录组或基因表达层面，未必包含蛋白质、代谢物或其他组学数据。具体限制源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式应遵循 NCBI BioProject 的通用引用规范，并参考项目编号 990565。许可信息源站未提供，用户在使用数据前应查阅 NCBI 相关使用条款以及原始研究项目可能附带的许可声明。由于源站未提供具体引用格式或许可细节，建议用户直接访问 NCBI BioProject 页面获取最新信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236319

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA990565

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

I型干扰素（IFN-I）在系统性红斑狼疮（SLE）及许多其他自身免疫性疾病的发生发展中至关重要。为探索IFN-I信号通路的代谢调控机制，我们对小分子化合物库进行了高通量筛选，并鉴定出香叶木素（diosmetin）是一种能有效阻断IFN-I信号的化合物。香叶木素可改善IFNα加速的NZB/NZW F1狼疮模型和降植烷诱导的小鼠狼疮模型中的狼疮样自身免疫表型。值得注意的是，香叶木素可通过降低CYP1B1的表达，阻断狼疮患者外周血单个核细胞（PBMCs）中过度激活的IFN-I信号通路。我们的研究揭示了IFN-I信号的一种新型脂质代谢调控机制，并为IFN-I信号通路过度激活的自身免疫性疾病提供了一个有效的替代治疗靶点。总体设计：研究香叶木素在THP-1细胞系和原代单核细胞中对I型干扰素信号的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别