PRJNA636086：M. guilliermondii 对巨噬细胞吞噬的响应

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA636086

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数据说明

致病性念珠菌属真菌是机会性、医院相关性血流感染的主要病因，死亡率高，通常发生于免疫功能低下患者。包括感染最常见病因白色念珠菌在内的数个物种，属于酵母菌的单系CUG进化支。关于白色念珠菌与先天免疫细胞的相互作用已有较多了解，这些免疫细胞对控制感染至关重要。白色念珠菌被吞噬可诱导若干参与非葡萄糖碳源分解代谢途径的转录诱导，这些途径对毒力很重要，被称为替代碳代谢。然而，其他CUG进化支物种的反应尚未得到表征。在一个单独的数据集中，我们分析了六种念珠菌对原代小鼠骨髓来源巨噬细胞的转录反应。在此，我们额外分析了M. guilliermondii的反应，这种酵母已知可引起播散性念珠菌病以及皮肤感染。我们发现，与其他CUG进化支念珠菌物种类似，它对吞噬作用产生了强烈的替代碳代谢反应。总体设计：M.的转录反应。

通过将季也蒙毕赤酵母真菌在含有或不含原代巨噬细胞的哺乳动物培养基中孵育1小时，随后进行RNA提取和测序，分析了季也蒙毕赤酵母对吞噬作用的反应。此实验重复进行了三次。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。