PRJNA1444016：Akh 在果蝇 C 病毒感染诱导的全身基因表达变化中的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1444016

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

果蝇C病毒（DCV）是一种天然病原体，可在黑腹果蝇中诱发严重的全身性消耗和代谢功能障碍。在本研究中，我们鉴定出脂动激素（Akh）——哺乳动物胰高血糖素的功能类似物——是这一过程的中心内分泌介质。我们的结果表明，DCV感染显著增加Akh的产生和信号传导，这与宿主消耗表型的进展密切相关，包括脂质丢失、高血糖、肌肉功能障碍和卵巢萎缩。为阐明Akh介导消耗的转录组学基础，我们对四组全身体样本进行了RNA测序（RNA-seq）：野生型（WT）和Akh缺失突变体果蝇，每组分别接受PBS（对照）或DCV处理。差异表达分析显示，相当一部分基因（183个上调，308个下调）以Akh依赖的方式受DCV调控。这些基因主要富集于与碳水化合物、脂质和蛋白质代谢相关的通路中。

值得注意的是，尽管DCV感染也会影响系统性胰岛素通路以及多种应激相关信号轴（如Jak/Stat、TNF/JNK），但这些改变在很大程度上独立于Akh。我们的研究结果表明，Akh通过一条独特的调控轴驱动感染诱导的能量消耗。该数据集为理解调控宿主-病原体相互作用和代谢稳态的内分泌机制提供了全面的资源。总体设计：将指定基因型（w1118和Akh突变体：AkhA）的果蝇分别进行PBS或果蝇C病毒（DCV）感染。在感染后5.5天（dpi）收集w1118的全蝇体，在3.5 dpi收集AkhA的全蝇体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。