PRJNA1390887：鼠γ疱疹病毒68裂解感染期间宿主转录重塑的时间序列RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1390887

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

进行批量RNA测序以表征裂解性鼠γ疱疹病毒68（MHV-68）感染期间宿主转录变化。NIH 3T3细胞分别接受模拟感染或MHV-68感染（感染复数5），并在感染后4、8、12和24小时收获，分别代表裂解性复制的即早期至极晚期阶段。差异表达分析揭示了宿主基因表达的广泛且时间依赖性重塑，涉及免疫、代谢、染色质相关及转录通路。该数据集为理解生产性裂解性γ疱疹病毒感染期间的宿主反应提供了时间框架。总体设计：在四个时间点（处理后4、8、12和24小时），对感染MHV-68的NIH3T3细胞与模拟对照（未感染）进行批量RNA-seq分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。