PRJNA1353674：秀丽隐杆线虫转录组或基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1353674

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

肠道沙门菌副伤寒A血清型（SPA）是人间副伤寒的致病菌，通常表现为发热、腹痛、腹泻和恶心等症状。严重病例可导致危及生命的全身性并发症。本课题组前期工作表明，SPA可感染秀丽隐杆线虫（C. elegans）并缩短其寿命。进一步采用油红O染色研究发现，SPA处理显著降低了秀丽隐杆线虫体内脂滴的积累。为探究其潜在分子机制，我们进行了转录组分析，结果显示SPA调控野生型N2秀丽隐杆线虫中213个基因的表达。具体而言，脂肪酸代谢相关基因acox-1.5和ech-9的表达显著上调，而acs-2的表达下调。此外，SPA抑制了多个P450解毒基因的表达，包括CYP-35A3、CYP-35A2、CYP-35B1和CYP-35C1。本研究揭示了SPA通过靶向秀丽隐杆线虫的代谢和解毒途径促进免疫逃逸的一种机制。

这些发现增进了我们对SPA发病机制的理解，并为预防和治疗策略的开发提供了理论基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。