PRJNA1090418:肌酸与多胺在胎儿生长受限中的核心作用
该数据集来自 NCBI,围绕胎儿生长受限(FGR)与适于胎龄(AGA)新生儿的差异展开,包含转录组与代谢组分析数据。研究通过 RNA-seq 数据与 POP 数据集胎盘转录组比较,识别出共同富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变

基本信息
资源简介
PRJNA1090418:肌酸与多胺在胎儿生长受限中的核心作用
该数据集来自 NCBI,围绕胎儿生长受限(FGR)与适于胎龄(AGA)新生儿的差异展开,包含转录组与代谢组分析数据。研究通过 RNA-seq 数据与 POP 数据集胎盘转录组比较,识别出共同富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变。数据可用于探索胎盘功能不全相关的代谢特征、筛选区分 FGR 与 AGA 的潜在标志物,并研究精氨酸合成磷酸肌酸及多胺生物合成增加在能量代谢补偿中的作用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):胎盘功能不全常与胎儿生长受限(FGR)相关,FGR 会给新生儿带来短期和长期并发症。在本研究中,我们进行了全面的转录组和代谢组分析,以描绘区分 FGR 新生儿与适于胎龄(AGA)新生儿的代谢特征。通过将我们的 RNA-seq 数据与 POP 数据集的胎盘转录组数据进行比较,我们识别出共同的富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变。在 FGR 婴儿中,胎盘功能不全倾向于促进无氧代谢,导致 ATP 生成受限。为应对这种不足,精氨酸被用于合成磷酸肌酸,这是一种对 ATP 生成至关重要的高能化合物。多胺生物合成增加
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1090418
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1090418
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以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胎盘功能不全常与胎儿生长受限(FGR)相关,而FGR是一种与新生儿短期和长期并发症均相关的病症。在本研究中,我们进行了全面的转录组学和代谢组学分析,以描绘能够区分FGR新生儿与适于胎龄(AGA)新生儿的代谢特征。通过将我们的RNA-seq数据与POP数据集中的胎盘转录组数据进行比较,我们识别出共同的富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变。在FGR婴儿中,胎盘功能不全倾向于促进无氧代谢,导致ATP生成受限。为弥补这一不足,精氨酸被用于合成磷酸肌酸——一种对ATP生成至关重要的高能化合物。此外,我们的观察显示,SAT1乙酰转移酶上调,导致FGR婴儿胎盘中亚精胺和N1-乙酰亚精胺浓度降低,以及N1,N8-二乙酰亚精胺浓度升高。
总之,我们的研究增进了对FGR中与胎盘功能障碍相关的代谢适应的理解,并为未来的治疗干预提供了宝贵的见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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