PRJNA1090418:肌酸与多胺在胎儿生长受限中的核心作用

该数据集来自 NCBI,围绕胎儿生长受限(FGR)与适于胎龄(AGA)新生儿的差异展开,包含转录组与代谢组分析数据。研究通过 RNA-seq 数据与 POP 数据集胎盘转录组比较,识别出共同富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变

sra
浏览 8
基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1090418: The central role of creatine and polyamines in fetal growth restriction

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1090418:肌酸与多胺在胎儿生长受限中的核心作用

该数据集来自 NCBI,围绕胎儿生长受限(FGR)与适于胎龄(AGA)新生儿的差异展开,包含转录组与代谢组分析数据。研究通过 RNA-seq 数据与 POP 数据集胎盘转录组比较,识别出共同富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变。数据可用于探索胎盘功能不全相关的代谢特征、筛选区分 FGR 与 AGA 的潜在标志物,并研究精氨酸合成磷酸肌酸及多胺生物合成增加在能量代谢补偿中的作用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胎盘功能不全常与胎儿生长受限(FGR)相关,FGR 会给新生儿带来短期和长期并发症。在本研究中,我们进行了全面的转录组和代谢组分析,以描绘区分 FGR 新生儿与适于胎龄(AGA)新生儿的代谢特征。通过将我们的 RNA-seq 数据与 POP 数据集的胎盘转录组数据进行比较,我们识别出共同的富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变。在 FGR 婴儿中,胎盘功能不全倾向于促进无氧代谢,导致 ATP 生成受限。为应对这种不足,精氨酸被用于合成磷酸肌酸,这是一种对 ATP 生成至关重要的高能化合物。多胺生物合成增加

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1090418

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1090418

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胎盘功能不全常与胎儿生长受限(FGR)相关,而FGR是一种与新生儿短期和长期并发症均相关的病症。在本研究中,我们进行了全面的转录组学和代谢组学分析,以描绘能够区分FGR新生儿与适于胎龄(AGA)新生儿的代谢特征。通过将我们的RNA-seq数据与POP数据集中的胎盘转录组数据进行比较,我们识别出共同的富集类别,尤其是缺氧,以及肌酸和精氨酸代谢的改变。在FGR婴儿中,胎盘功能不全倾向于促进无氧代谢,导致ATP生成受限。为弥补这一不足,精氨酸被用于合成磷酸肌酸——一种对ATP生成至关重要的高能化合物。此外,我们的观察显示,SAT1乙酰转移酶上调,导致FGR婴儿胎盘中亚精胺和N1-乙酰亚精胺浓度降低,以及N1,N8-二乙酰亚精胺浓度升高。

总之,我们的研究增进了对FGR中与胎盘功能障碍相关的代谢适应的理解,并为未来的治疗干预提供了宝贵的见解。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案