不同PBC患者UDCA应答的肠道微生物与代谢组数据集

研究依据Paris-I/II标准将患者分为UDCA完全应答组与应答不佳组,采集两组患者粪便,观察粪便微生物多态性差异,并采用代谢蛋白质组学方法研究两组患者血清和粪便中胆汁酸与短链脂肪酸的代谢差异

Sun Yat-sen UniversitySun Yat-sen University
clinicaltrials
浏览 9
蛋白质分类Primary Biliary Cirrhosis
Gut Microbes and Metabolic Group in Different PBC Patients for UDCA Response

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

不同PBC患者UDCA应答的肠道微生物与代谢组数据集

该数据集英文名为 Gut Microbes and Metabolic Group in Different PBC Patients for UDCA Response,来源于 clinicaltrials.gov,主题标签为 Primary Biliary Cirrhosis(原发性胆汁性肝硬化),本站分类归入内分泌、营养和代谢疾病 / 其他。数据集围绕接受熊去氧胆酸(UDCA)治疗的 PBC 患者展开:入组患者均已接受 UDCA 治疗超过 1 年,依据 Paris-I/II 标准被划分为 UDCA 完全应答组与应答不佳组;研究采集两组患者的粪便样本,观察粪便微生物多态性差异,并采用代谢蛋白质组学方法研究两组患者血清和粪便中胆汁酸与短链脂肪酸的代谢差异。该数据集可用于探索 PBC 患者 UDCA 应答差异与肠道微生物及代谢特征之间的关联。

【数据集背景】

原发性胆汁性肝硬化是一种以胆汁淤积为特征的慢性肝病,UDCA 是其常用治疗药物,但不同患者的治疗应答存在差异。该研究以接受 UDCA 治疗超过 1 年的 PBC 患者为对象,按照 Paris-I/II 标准区分 UDCA 完全应答组与应答不佳组,试图从肠道微生物和代谢层面刻画两组患者的差异。数据集的主题标签为 Primary Biliary Cirrhosis,本站分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 其他,来源站为 clinicaltrials.gov。

【数据内容】

数据集覆盖两类患者分组:UDCA 完全应答组和应答不佳组。数据内容涉及两个层面:一是两组患者粪便微生物的多态性差异,即对粪便微生物群落多态性进行观察比较;二是两组患者血清和粪便中胆汁酸与短链脂肪酸的代谢差异,采用代谢蛋白质组学方法进行研究。源站描述未提供样本量、具体微生物种类、代谢物浓度数值或统计结果等细节。

【采集与来源】

数据来源于 clinicaltrials.gov 登记的研究。研究对象为已入组并接受 UDCA 治疗超过 1 年的 PBC 患者,分组依据为 Paris-I/II 标准。采集的生物样本包括两组患者的粪便,用于微生物多态性观察;同时涉及血清和粪便样本,用于胆汁酸与短链脂肪酸的代谢蛋白质组学研究。源站未提供采集时间窗、样本保存条件、测序或代谢组学平台等具体信息。

【适用场景】

该数据集适用于研究 PBC 患者 UDCA 应答差异与肠道微生物多态性、胆汁酸代谢及短链脂肪酸代谢之间关系的场景,也可用于比较完全应答与应答不佳两类患者在粪便微生物和血清、粪便代谢物层面的差异。由于涉及内分泌、营养和代谢疾病分类,亦可作为相关代谢特征分析的参考数据。源站未提供其他具体适用场景。

【使用方法】

使用时可依据 Paris-I/II 标准所划分的 UDCA 完全应答组与应答不佳组进行分组比较,分别分析粪便微生物多态性差异,以及血清和粪便中胆汁酸与短链脂肪酸的代谢差异。源站未提供具体的数据格式、字段说明、分析流程或代码示例。

【质量与限制】

源站未提供样本量、数据完整性、缺失值处理、质量控制指标或验证结果等信息。数据集基于特定入组条件(UDCA 治疗超过 1 年)和特定分组标准(Paris-I/II),其适用范围受源站描述所限。源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03590886

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:原发性胆汁性肝硬化。研究纳入接受UDCA治疗超过1年的PBC患者,根据Paris-I/II标准分为UDCA完全应答组和其他应答不佳组。收集两组患者的粪便,观察两组粪便微生物多态性的差异。采用代谢蛋白质组学方法研究两组PBC患者血清和粪便中胆汁酸及短链脂肪酸的代谢差异。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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