数据来源:果蝇关键中心代谢基因的遗传扰动延长寿命并影响对饮食限制的响应

该数据集来自 Dryad,包含果蝇中七个中心代谢酶基因表达降低对寿命影响的研究数据,并对比正常饮食与饮食限制两种条件。研究采用 P-element 诱变方法,发现七个基因中有五个在一种或两种饮食下降低表达可延长寿命,其中两个涉及氧化还原平衡,己糖激酶降低活性也延长寿命,这些均与 ATP/ADP 比值

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时间序列回归caloric restrictionredox balanceenergy homeostasis
Data from: Genetic perturbation of key central metabolic genes extends life span in Drosophila and affects response to dietary restriction

基本信息

模态
时间序列
大小
0.000444324 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

数据来源:果蝇关键中心代谢基因的遗传扰动延长寿命并影响对饮食限制的响应

Data from: Genetic perturbation of key central metabolic genes extends life span in Drosophila and affects response to dietary restriction

该数据集来自 Dryad,包含果蝇中七个中心代谢酶基因表达降低对寿命影响的研究数据,并对比正常饮食与饮食限制两种条件。研究采用 P-element 诱变方法,发现七个基因中有五个在一种或两种饮食下降低表达可延长寿命,其中两个涉及氧化还原平衡,己糖激酶降低活性也延长寿命,这些均与 ATP/ADP 比值及 AMP 活化蛋白激酶作用相关。数据可用于分析代谢基因表达、能量稳态与寿命及饮食限制响应之间的关系(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2015。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):营养输入、能量感知通路、寿命变异与衰老之间存在联系。尽管代谢酶在能量稳态中的作用及其代谢物作为营养信号的作用已被认识,但关于它们的基因表达如何影响寿命却知之甚少。在本报告中,我们利用果蝇中的 P-element 诱变,研究七个中心代谢酶表达降低对寿命的影响,并对比在正常饮食和饮食限制下的效应。主要观察结果是,对于七个基因中的五个,基因表达降低在一种或两种饮食下均延长寿命。两个基因参与氧化还原平衡,我们观察到较低活性基因型显著延长寿命。己糖激酶也显示基因活性降低时寿命延长。由于两者都影响 ATP/ADP 比值,这与 AMP 活化蛋白的作用相关

【主题与分类】

主题标签:caloric restriction、redox balance、energy homeostasis。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.r620q

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.r620q

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 444.3 KB。

数据说明

营养输入、能量感知途径、寿命变异与衰老之间存在关联。尽管代谢酶在能量稳态中的作用及其代谢产物作为营养信号已有所知,但关于其基因表达如何影响寿命却知之甚少。在本报告中,我们利用果蝇中的P元件诱变技术,研究了七种中心代谢酶表达量降低对寿命的影响,并对比了在正常饮食与饮食限制条件下的效果。主要观察结果是,对于七个基因中的五个,基因表达的减少能在一种或两种饮食条件下延长寿命。其中两个基因涉及氧化还原平衡,我们观察到活性较低的基因型显著延长了寿命。己糖激酶同样显示出基因活性降低伴随寿命延长。由于两者均影响ATP/ADP比率,这与AMP活化蛋白激酶作为能量传感器在调节寿命及介导热量限制中的作用相关联。这些基因在自然群体中拥有显著的表达变异,而我们的实验基因型涵盖了这种自然活性变异的水平。

我们的研究将能量状态的读取与中心代谢基因的扰动联系起来,并证明了它们对寿命的影响。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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