数据来源：砷酸盐替代对细胞磷酸盐库影响的计算研究

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.56bq0m1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 69.0 MB。

数据说明

砷酸盐与磷酸盐的结构相似性使其能够进入生物体内与磷酸盐相关的各种代谢过程。然而，要评估砷酸盐取代对单个生物磷酸盐物种稳定性的影响却十分困难，这些物种范围从较简单的单酯形式（如焦磷酸盐）到更复杂的磷酸二酯变体（如DNA）。在本研究中，我们根据结构差异将生理性磷酸酯分为三个不同的类别。这一分类有助于我们开展一项简洁的理论研究，探讨砷酸盐的磷酸类似物物种在水解方面的动力学稳定性。所有计算均采用我们自主研发的ONIOM（Our Own N-layer Integrated molecular Orbital molecular Mechanics）QM/MM方法进行。对于量子力学区域，我们使用了M06-2X密度泛函方法，基组为6-31+G(2d,2p)；对于分子力学区域，使用了AMBER力场。计算得到的水解速率常数表明，砷酸盐的磷酸类似物物种均不具备合理的水解稳定性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。