腹主动脉瘤分期相关HLA-II连锁巨噬细胞免疫代谢程序:整合转录组与遗传学研究

该数据集为腹主动脉瘤分期相关HLA-II连锁巨噬细胞免疫代谢程序研究的可重复性材料包,整合四个公开bulk转录组队列、两个独立处理的单细胞RNA测序数据集以及靶向cis-pQTL与腹主动脉瘤全基因组关联汇总数据

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2026-07-20 更新
浏览 7
基因组预测abdominal aortic aneurysm
<b>Stage-Associated HLA-II-Linked Macrophage Immunometabolic Programs in Abdominal Aortic Aneurysm: An Integrative Transcriptomic and Genetic Study</b>

基本信息

模态
基因组
大小
0.012155172 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-07-20
版本
v1

资源简介

腹主动脉瘤分期相关HLA-II连锁巨噬细胞免疫代谢程序:整合转录组与遗传学研究

Stage-Associated HLA-II-Linked Macrophage Immunometabolic Programs in Abdominal Aortic Aneurysm: An Integrative Transcriptomic and Genetic Study

该数据集为腹主动脉瘤分期相关HLA-II连锁巨噬细胞免疫代谢程序研究的可重复性材料包,整合四个公开bulk转录组队列、两个独立处理的单细胞RNA测序数据集以及靶向cis-pQTL与腹主动脉瘤全基因组关联汇总数据。分析涵盖分期相关主动脉组织程序、巨噬细胞状态异质性、跨队列签名投影、患者水平pseudobulk差异、转录因子活性、留一轴敏感性分析及靶向孟德尔随机化与共定位,可用于复现该研究的转录组与遗传学整合分析流程(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-07-20。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该存储库包含支持题为“Stage-Associated HLA-II-Linked Macrophage Immunometabolic Programs in Abdominal Aortic Aneurysm: An Integrative Transcriptomic and Genetic Study”手稿的可重复性材料。该研究整合了四个公开可用的bulk转录组队列(GSE57691、GSE47472、GSE7084和GSE98278)、两个独立处理的单细胞RNA测序数据集(GSE166676和GSE237230),以及靶向cis-pQTL和腹主动脉瘤全基因组关联汇总数据。分析考察了分期相关主动脉组织程序、巨噬细胞状态异质性、相互跨队列签名投影、患者水平pseudobulk差异、转录因子活性、留一轴敏感性分析,以及靶向孟德尔随机化和共定位。所存缴的数据包包括:• 完整的R脚本用于

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 12.16 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.33006473.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Preventative health care。主题标签:abdominal aortic aneurysm。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Preventative health care。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/_b_Stage-Associated_HLA-II-Linked_Macrophage_Immunometabolic_Programs_in_Abdominal_Aortic_Aneurysm_An_Integrative_Transcriptomic_and_Genetic_Study_b_/33006473

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Zhao, Kaixun (2026). Stage-Associated HLA-II-Linked Macrophage Immunometabolic Programs in Abdominal Aortic Aneurysm: An Integrative Transcriptomic and Genetic Study. figshare. Dataset

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 12.2 MB。

数据说明

本仓库包含支持题为“腹主动脉瘤中与分期相关的HLA-II连锁巨噬细胞免疫代谢程序:一项整合转录组学与遗传学研究”的手稿的可重复性材料。该研究整合了四个公开可用的批量转录组队列(GSE57691、GSE47472、GSE7084和GSE98278)、两个独立处理的单细胞RNA测序数据集(GSE166676和GSE237230),以及靶向cis-pQTL和腹主动脉瘤全基因组关联汇总数据。

这些分析考察了分期相关的主动脉组织程序、巨噬细胞状态异质性、跨队列交互特征投射、患者水平的伪批量差异、转录因子活性、留一轴敏感性分析,以及靶向孟德尔随机化和共定位。所提交的数据包包括:• 用于批量转录组、单细胞、通路富集、转录因子、敏感性、遗传学和图形生成分析的完整R脚本 • 机器可读的衍生数据和分析输出 • 主表和补充表 • 补充图 • 基因集定义、软件版本、质量控制记录、过滤审计和分析参数摘要 • 参考文库和文档文件 • 完整的文件索引和SHA-256完整性校验和 • 重现分析及检索原始公共数据集的说明。该存储库组织在一个带版本的项目目录下,并使用相对路径以提高可移植性。

分析在R 4.5.1中进行;软件包版本和主要计算参数记录在补充可重复性表格及随附的README文件中。原始GEO表达矩阵、受保护或外部托管的GWAS汇总统计数据以及完整的pQTL源数据集未在此存档中重新分发。用户应从原始存储库和数据生成研究中获取这些材料,并在a

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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