Ampk alpha2 T172激活决定运动表现与骨骼肌能量转导

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A9f83ce6d61558c4167575cdc324be494330018919559cdef1458256a3318b7a2

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数据说明

AMPK（5′-AMP激活蛋白激酶）是代谢调节与整合的能量感受器。本研究采用CRISPR/Cas9技术构建了不可激活的Ampkα敲入（KI）小鼠，将苏氨酸172磷酸化位点突变为丙氨酸，从而规避了以往遗传干预破坏蛋白质化学计量比的局限性。Ampkα2而非Ampkα1的KI小鼠表现出表型变化，包括脂肪与瘦体重比值增加、耐力运动能力受损以及骨骼肌线粒体最大呼吸和传导性降低。在静息和运动状态下对骨骼肌进行的整合时序多组学分析（蛋白质组学/磷酸化蛋白质组学/代谢组学）确立了Ampkα2 T172激活在糖酵解与氧化代谢、线粒体呼吸及收缩功能中具有多效但至关重要的作用。

重要的是，Ampkα2 T172A KI小鼠骨骼肌蛋白质组变化与……存在显著重叠，LC-MS/MS蛋白质组学与磷酸化蛋白质组学 肌肉组织样本取自雄性和雌性WT与KI小鼠，分别于运动前（即久坐对照，SED）、10分钟跑步后（10 min）及力竭后（Exh.）采集，并储存于-80ºC直至处理。全局蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析的样本处理按先前描述（71）进行，并作了若干修改。简言之，将冷冻肌肉组织样本在预冷的铝盘上用干冰切碎。收集约25 mg组织，在预冷的珠磨仪上用冷裂解缓冲液（50 mM Tris，8 M尿素，75 mM NaCl，1 mM EDTA，2 µg/mL抑肽酶，10 µg/mL亮抑酶肽，1 mM PMSF，10 mM NaF，1%磷酸酶抑制剂混合物2，1%磷酸酶抑制剂混合物3，pH 8.0）以2分钟循环匀浆。随后样本在4 °C下以13,000xg离心10分钟以去除碎片。提取的蛋白质通过CA法进行定量。相同数量的

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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