Harmonia 协调 GWAS 汇总统计—血脂与脂蛋白：总胆固醇、甘油三酯与脂蛋白(a)，泛祖先（第4部分，共4部分）
该数据集为 Harmonia 协调后的 GWAS 汇总统计，聚焦血脂与脂蛋白类别中的总胆固醇、甘油三酯和脂蛋白(a)，覆盖泛祖先样本，属于四部分中的第 4 部分
基本信息
资源简介
Harmonia 协调 GWAS 汇总统计—血脂与脂蛋白：总胆固醇、甘油三酯与脂蛋白(a)，泛祖先（第4部分，共4部分）
Harmonia harmonized GWAS summary statistics — Lipids and lipoproteins: Total cholesterol, triglycerides, and lipoprotein(a), pan-ancestry (part 4 of 4)
该数据集为 Harmonia 协调后的 GWAS 汇总统计，聚焦血脂与脂蛋白类别中的总胆固醇、甘油三酯和脂蛋白(a)，覆盖泛祖先样本，属于四部分中的第 4 部分。数据经 Harmonia v1.5.0 处理，生成 COJO 与 LD-score 回归格式输出，每个研究归档同时提供 GRCh38/hg38 主构建与 GRCh37/hg19 liftover 构建，并附清单文件列出研究、性状、祖先、构建、样本量、PMID 及变异计数。仅纳入允许公开再分发的许可研究，可用于血脂相关遗传关联分析与跨祖先研究（来源 DOI 解析，Creative Commons Attribution 4.0 International 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含 3 项公开研究的协调 GWAS 汇总统计，覆盖一个性状类别：泛祖先样本中的血脂与脂蛋白——总胆固醇、甘油三酯和脂蛋白(a)（第 4 部分，共 4 部分）。文件使用 Harmonia v1.5.0（ 10.5281/zenodo.21420283）处理，该工具协调 GWAS 汇总统计并生成 COJO 和 LD-score 回归格式输出。每个研究归档（.tar.gz）包含 GRCh38/hg38（主）和 GRCh37/hg19（b37，通过 liftover）两种构建的输出。清单文件（manifest_upload20.tsv）列出所有纳入研究及其性状名称、祖先、构建、样本量、PMID、COJO 变异数和 LDSC 变异数。仅纳入具有宽松公开再分发许可的研究；受数据使用协议或限制访问的研究被排除。该数据
【主题与分类】
主题标签：GWAS summary statistics。本站分类：内分泌系统疾病/血脂异常。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23055008
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23055008
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 27.32 GB。
数据说明
该数据集包含3项公开研究的协调后GWAS汇总统计量，涵盖一个性状类别：血脂与脂蛋白——全祖先样本中的总胆固醇、甘油三酯和脂蛋白(a)（第4部分，共4部分）。文件使用Harmonia v1.5.0（https://github.com/CirculatoryHealth/Harmonia；DOI：10.5281/zenodo.21420283）处理，该工具可协调GWAS汇总统计量并生成COJO和LD-score回归格式的输出。每个单研究归档文件（.tar.gz）均包含GRCh38/hg38（主要）和GRCh37/hg19（b37，通过liftover转换）两种构建版本的输出。清单文件（manifest_upload20.tsv）列出了所有纳入研究及其性状名称、祖先、构建版本、样本量、PMID、COJO变异数和LDSC变异数。仅纳入具有宽松公开再分发许可的研究；受数据使用协议约束或访问受限的研究被排除。该数据集是Zenodo系列上传的一部分，该系列涵盖使用Harmonia处理的116项GWAS汇总统计量。随附的软件论文为：van der Laan SW等，Harmonia：一套将GWAS汇总统计量协调为标准化格式的工具套件。F1000Research（2026）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
