PRJNA266871:不同饮食方案下小鼠棕色脂肪时间序列基因表达谱 [棕色脂肪]

该数据集来自 NCBI,围绕 C57BL/6J 小鼠棕色脂肪,采集不同饮食方案下的基因表达变化。实验包含低脂对照饮食、高脂饮食,以及在高脂饮食基础上添加三种剂量(5 µg、20 µg、75 µg)乙醇植物配方 Kal-1 的组别,每组设三个生物学重复

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基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA266871: Temporal gene expression profiling of murine brown adipose with different diet regimens [brown adipose]

基本信息

模态
基因组
任务类型
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创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA266871:不同饮食方案下小鼠棕色脂肪时间序列基因表达谱 [棕色脂肪]

该数据集名为“PRJNA266871: Temporal gene expression profiling of murine brown adipose with different diet regimens [brown adipose]”,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),在本站被归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病方向。数据集围绕 C57BL/6J 小鼠的棕色脂肪组织,采集不同饮食方案下的基因表达变化。实验设计涵盖低脂对照饮食(LFC)、高脂饮食(HFC),以及在高脂饮食基础上添加三种剂量(5 µg、20 µg、75 µg)乙醇植物配方 Kal-1 的组别,每组设置三个生物学重复。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,属于转录组或基因表达层面的数据资源。

【数据集背景】

该数据集以 C57BL/6J 小鼠作为研究饮食诱导糖尿病和肥胖的模型。源站描述指出,该品系会积累脂肪组织质量、出现胰岛素抵抗、高胰岛素血症和高脂血症,这些特征与人类在摄入高脂高糖饮食(HFHSD)后表现出的状态相似。因此,该数据集所涉及的饮食方案和棕色脂肪基因表达变化,处于饮食、代谢与糖尿病相关研究的背景之下。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,也反映了该数据集在代谢性疾病研究方向上的定位。

【数据内容】

数据集的核心内容是棕色脂肪中的基因表达变化。实验分组包括:低脂对照饮食(LFC)、高脂饮食(HFC),以及在高脂饮食基础上分别添加 5 µg、20 µg 和 75 µg 三种剂量乙醇植物配方 Kal-1 的组别。每个组别均包含三个生物学重复。数据主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明数据属于转录组或基因表达类型。除上述分组和重复信息外,源站未提供关于具体基因列表、表达量数值、测序平台、 reads 数或差异表达分析结果的更多细节。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名称中包含 PRJNA266871 这一编号。源站描述说明了实验使用的动物模型为 C57BL/6J 小鼠,研究目的是通过不同饮食方案观察棕色脂肪的基因表达变化。实验设计明确列出了低脂对照饮食、高脂饮食以及三种剂量的 Kal-1 配方与高脂饮食组合的组别,并说明每组有三个生物学重复。关于样本采集的具体时间点、组织处理流程、RNA 提取方法、测序平台或数据提交时间等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究饮食因素对棕色脂肪基因表达影响的场景,尤其是与饮食诱导的糖尿病和肥胖相关的代谢研究。由于包含低脂对照、高脂饮食以及在高脂饮食基础上添加不同剂量 Kal-1 的组别,该数据集可用于探索高脂饮食背景下棕色脂肪转录组的变化,以及不同剂量乙醇植物配方 Kal-1 可能带来的基因表达差异。其主题标签“Transcriptome or Gene expression”也表明,该数据适合用于转录组层面的分析或作为基因表达研究的参考数据。但具体分析目标和方法需结合使用者自身的研究设计。

【使用方法】

该数据集来源于 NCBI,可通过 ncbi.nlm.nih.gov 获取。数据集名称中包含 PRJNA266871,可作为检索或引用时的标识。由于源站未提供关于数据格式、下载方式、预处理步骤或分析流程的详细说明,使用者需要根据 NCBI 平台上的实际数据组织方式进行访问和利用。该数据集包含三个生物学重复,可用于组间比较,但具体的统计方法、归一化策略和差异表达分析工具需由使用者自行确定。源站未提供关于数据使用步骤的进一步指导。

【质量与限制】

该数据集设置了三个生物学重复,这为组间比较提供了一定的重复性基础。实验设计明确区分了低脂对照饮食、高脂饮食以及三种剂量的 Kal-1 干预组,分组信息较为清晰。然而,源站未提供关于测序深度、数据质量评分、批次效应、样本处理时间点或数据完整性等方面的具体信息。此外,该数据集仅涉及 C57BL/6J 小鼠的棕色脂肪,研究结论向其他组织、其他品系或人类转化的适用性需谨慎评估。源站未提供关于数据质量控制的详细说明,也未提供关于潜在限制的明确描述。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名称中包含 PRJNA266871。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或授权信息,源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集,应参考 NCBI 平台上的相关说明或联系数据提交者获取进一步信息。源站未提供关于许可和引用的具体内容。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA266871

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们使用C57BL/6J小鼠作为研究饮食诱导的糖尿病和肥胖的模型,因为该品系在喂食高脂高糖饮食(HFHSD)时,会像人类一样积累脂肪组织量、产生胰岛素抵抗、高胰岛素血症和高脂血症。总体设计:该数据集包含棕色脂肪中的基因表达变化。它包括低脂对照饮食(LFC)、高脂饮食(HFC)以及三种不同剂量(5 µg、20 µg和75 µg)的乙醇植物配方Kal-1与HFC饮食组合的三个生物学重复。

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