不同饮食方案下小鼠海马时间序列基因表达谱
该数据集来自 NCBI,记录了 C57BL/6J 小鼠在不同饮食方案下海马的基因表达变化。实验包含低脂对照饮食、高脂饮食以及高脂饮食联合三种剂量(5 µg、20 µg、75 µg)的 ethano-botanical 配方 Kal-1,每组设三个生物学重复
![PRJNA266865: Temporal gene expression profiling of murine hippocampus with different diet regimens [Hippocampus]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/124694.jpg)
基本信息
资源简介
不同饮食方案下小鼠海马时间序列基因表达谱
PRJNA266865 数据集记录了 C57BL/6J 小鼠在不同饮食方案下海马组织的基因表达变化,属于内分泌、营养和代谢疾病领域中与糖尿病相关的研究数据。该数据集来源于 NCBI,主题标签为转录组或基因表达。实验设计涵盖低脂对照饮食、高脂饮食,以及高脂饮食联合三种不同剂量(5 µg、20 µg 和 75 µg)的 ethano-botanical 配方 Kal-1,每组设置三个生物学重复。整体而言,该数据集可用于观察饮食干预对小鼠海马基因表达的影响,并为饮食诱导的糖尿病和肥胖相关研究提供转录组层面的数据支持。
【数据集背景】
该数据集所依托的研究使用 C57BL/6J 小鼠作为研究饮食诱导糖尿病和肥胖的模型。选择该品系的依据在于,该品系在摄入高脂高糖饮食后,会像人类一样出现脂肪组织质量积累、胰岛素抵抗、高胰岛素血症和高脂血症等特征。研究关注的是不同饮食方案下小鼠海马的基因表达变化,因此该数据集属于转录组或基因表达范畴,并与内分泌、营养和代谢疾病以及糖尿病方向相关。
【数据内容】
该数据集由海马组织中的基因表达变化数据构成。实验分组包括低脂对照饮食、高脂饮食,以及高脂饮食联合三种不同剂量的 ethano-botanical 配方 Kal-1,剂量分别为 5 µg、20 µg 和 75 µg。每一组均包含三个生物学重复。数据集的主题标签为转录组或基因表达,说明其核心内容围绕基因表达谱展开。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集英文名称为 PRJNA266865: Temporal gene expression profiling of murine hippocampus with different diet regimens [Hippocampus]。源站描述指出,研究使用 C57BL/6J 小鼠作为饮食诱导糖尿病和肥胖的模型,并记录了海马中的基因表达变化。关于样本采集的具体时间点、测序平台、建库方法、组织处理流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究不同饮食方案对小鼠海马基因表达的影响,尤其是低脂对照饮食、高脂饮食以及高脂饮食联合不同剂量 Kal-1 配方之间的比较。由于涉及饮食诱导的糖尿病和肥胖模型,该数据集也可用于与内分泌、营养和代谢疾病以及糖尿病相关的转录组分析。其主题标签为转录组或基因表达,因此适合用于基因表达层面的探索性分析。关于更具体的适用分析类型或疾病机制验证场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集包含低脂对照饮食、高脂饮食以及高脂饮食联合三种剂量 Kal-1 的组别,每组三个生物学重复,可用于组间基因表达差异比较。使用时可依据分组信息对海马基因表达变化进行对照分析。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法、分析工具或代码等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集设置了三个生物学重复,涵盖低脂对照饮食、高脂饮食以及高脂饮食联合三种剂量 Kal-1 的实验组。关于测序深度、数据完整性、批次效应、样本质量、统计功效、验证实验等质量相关信息,源站未提供。该数据集基于 C57BL/6J 小鼠海马组织,其结论外推到其他物种、其他脑区或其他饮食模型时需谨慎。关于具体限制条件,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名称为 PRJNA266865: Temporal gene expression profiling of murine hippocampus with different diet regimens [Hippocampus]。关于引用方式、许可协议、使用条款或授权信息,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA266865
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中,我们采用C57BL/6J小鼠作为研究饮食诱导糖尿病和肥胖的模型,因为该品系在喂食高脂高糖饮食(HFHSD)时,会像人类一样积累脂肪组织量、产生胰岛素抵抗、高胰岛素血症和高脂血症。总体设计:本数据集包含海马体中的基因表达变化。它包括低脂对照饮食(LFC)、高脂饮食(HFC)以及三种不同剂量(5微克、20微克和75微克)的乙醇植物制剂Kal-1配合HFC饮食的三个生物学重复。
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