人内皮细胞转录组分析鉴定糖尿病内皮功能障碍相关基因
该数据集来自 NCBI，聚焦糖尿病相关的内皮功能障碍。研究对非糖尿病、糖尿病前期和 2 型糖尿病供体的肠系膜动脉内膜进行转录组分析，并将差异表达基因与五种不同器官型内皮细胞在高糖和 TNFalpha 刺激下的结果进行比较
基本信息
资源简介
人内皮细胞转录组分析鉴定糖尿病内皮功能障碍相关基因
该数据集名为“PRJNA1502574: Transcriptome profiling of human endothelial cells identifies genes associated with endothelial dysfunction in diabetes”，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），归类于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。其核心内容围绕糖尿病相关的内皮功能障碍展开：内皮功能障碍是糖尿病最早发生的过程之一，也是驱动糖尿病并发症的关键机制。为理解内皮如何响应糖尿病性损伤，研究对来自非糖尿病、糖尿病前期和 2 型糖尿病供体的肠系膜动脉内膜进行了转录组分析，并将差异表达基因与五种不同器官型内皮细胞在高糖和 TNFalpha 刺激下的结果进行比较，从而提供涵盖体内与体外、以及不同血管床特异性内皮细胞亚型比较的基因表达谱资源。
【数据集背景】
糖尿病并发症的发生发展与内皮功能障碍密切相关，而内皮功能障碍被认为是糖尿病最早出现的过程之一，也是推动并发症形成的关键机制。要深入理解内皮细胞如何应对糖尿病性损伤，需要在真实人体组织和可控实验模型两个层面获取基因表达信息。该数据集正是基于这一需求，对非糖尿病、糖尿病前期和 2 型糖尿病状态的人体供体肠系膜动脉内膜进行转录组分析，同时结合体外糖尿病模拟刺激条件下的内皮细胞表达谱，以建立体内与体外之间的对照框架。
【数据内容】
数据集包含的基因表达谱来自两类材料：一是新鲜采集的供体动脉内膜，覆盖非糖尿病、糖尿病前期和 2 型糖尿病三种状态；二是原代内皮细胞培养物，接受糖尿病模拟刺激，即高糖和 TNFalpha 处理。研究对上述材料中的差异表达基因进行了比较，比较对象包括五种不同器官型的内皮细胞。整体资源支持体内与体外比较，以及血管床特异性内皮细胞亚型的比较。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明数据属于转录组或基因表达范畴。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。人体组织材料为去标识化的供体肠系膜动脉内膜，供体状态涵盖非糖尿病、糖尿病前期和 2 型糖尿病。体外材料为原代内皮细胞培养物，接受高糖和 TNFalpha 刺激以模拟糖尿病条件。关于具体的样本数量、供体人口学信息、测序平台、测序深度、试剂批次等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究糖尿病相关内皮功能障碍的基因表达变化，可用于比较非糖尿病、糖尿病前期和 2 型糖尿病状态下肠系膜动脉内膜的转录组差异。同时，由于包含原代内皮细胞在高糖和 TNFalpha 刺激下的表达谱，并涉及五种不同器官型内皮细胞，因此也适合开展体内与体外结果的对照分析，以及不同血管床来源内皮细胞亚型之间的比较研究。主题标签“Transcriptome or Gene expression”进一步说明其适用于基因表达层面的探索。
【使用方法】
该数据集提供的是基因表达谱资源，使用者可围绕差异表达基因开展分析，将人体供体动脉内膜的转录组结果与体外糖尿病模拟刺激下的内皮细胞结果进行比对。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、标准化方法、参考基因组版本以及配套代码等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的一个显著特点是同时涵盖新鲜采集的人体动脉内膜和原代内皮细胞培养物，支持体内与体外比较以及血管床特异性内皮细胞亚型比较。但关于样本量、统计功效、批次效应、测序质量指标、数据完整性以及潜在混杂因素等信息，源站未提供。使用者在解释结果时需注意这些未提供的信息可能带来的影响。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制以及是否需要获得额外授权等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1502574
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
内皮功能障碍是糖尿病中最早发生的过程之一，也是驱动糖尿病并发症的关键机制。为了解内皮如何应对糖尿病损伤，我们对来自非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态的去标识人类供体肠系膜动脉内膜进行了转录组分析。将差异表达基因与五种不同器官型内皮细胞（EC）在模拟糖尿病刺激（高糖和TNFα）处理后的基因表达进行了比较。该数据集提供了一个资源，涵盖从供体动脉新鲜收集的内膜以及接受糖尿病刺激的原代EC培养物的基因表达谱，使得能够进行体内-体外比较以及血管床特异性EC亚型比较。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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