PRJNA1304955：内皮富集lncRNA Gm39822调控非糖尿病内皮细胞炎症与功能障碍
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1304955），主题为转录组或基因表达，聚焦内皮富集 lncRNA Gm39822 对非糖尿病内皮细胞炎症与功能障碍的调控作用
基本信息
资源简介
PRJNA1304955：内皮富集lncRNA Gm39822调控非糖尿病内皮细胞炎症与功能障碍
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1304955），英文名称为“Endothelial-enriched lncRNA Gm39822 modulates inflammation and dysfunction in non-diabetic endothelial cells”，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达。其研究焦点是内皮富集的长链非编码 RNA Gm39822 对非糖尿病内皮细胞炎症与功能障碍的调控作用。本站将其归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病方向。该数据集以 BioProject 形式组织，旨在汇集与同一研究计划相关的多种生物数据，便于用户集中查找和访问由该项目产生的不同类型数据。整体而言，该数据集围绕内皮细胞中 lncRNA 的功能机制展开，属于基因表达与转录组研究范畴，可为相关领域的机制探索提供数据入口。
【数据集背景】
该数据集对应的研究关注内皮富集的长链非编码 RNA Gm39822 在非糖尿病内皮细胞中的作用。研究主题涉及炎症与功能障碍的调控，属于转录组或基因表达方向。本站将其分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病，提示该研究可能与代谢性疾病背景下的内皮功能问题存在关联。BioProject 作为生物数据集合，通常来源于单一机构或联盟发起的单一研究计划，并提供一个集中位置，让用户能够找到该项目产生的多种数据类型。该数据集的标题明确指向“非糖尿病内皮细胞”，说明其研究语境与糖尿病状态相区分，着重探讨在非糖尿病条件下内皮细胞中 Gm39822 对炎症和功能障碍的调节作用。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。数据集英文名称显示研究对象为内皮富集 lncRNA Gm39822，研究内容涉及其对非糖尿病内皮细胞炎症与功能障碍的调控。源站描述指出，BioProject 记录提供用户一个单一位置，用于查找为该项目生成的多种数据类型。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表、实验条件或分析结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI BioProject 数据库，记录 ID 为 1304955。源站标题为“Endothelial-enriched lncRNA Gm39822 modulates infl... (ID 1304955) - BioProject - NCBI”。根据源站描述，BioProject 是来源于单一组织或联盟、与单一研究计划相关的生物数据集合。除来源站和记录 ID 外，关于样本采集地点、时间、伦理审批、实验操作流程或具体提交机构等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关研究场景，尤其是关注内皮细胞中长链非编码 RNA 功能机制的方向。由于标题明确涉及内皮富集 lncRNA Gm39822 对非糖尿病内皮细胞炎症与功能障碍的调控，其潜在适用场景包括内皮细胞炎症机制研究、非糖尿病状态下内皮功能障碍的分子调控探索，以及 lncRNA 在代谢相关疾病背景下的功能研究。本站分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病，提示其也可能为糖尿病相关内皮功能研究提供对照或机制参考。但具体适用性需结合源站提供的完整数据内容判断，源站未提供详细使用建议。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1304955 访问该数据集入口。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供一个单一位置，以查找为该项目生成的多种数据类型。因此，使用方法通常包括通过 BioProject 页面获取该项目关联的数据链接，并进一步访问相应的转录组或基因表达数据。关于具体下载方式、文件格式、分析工具或数据处理流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。其主题标签为转录组或基因表达，研究焦点明确。然而，关于数据质量评估指标、样本量、测序深度、重复性、批次效应、数据完整性或验证实验结果等信息，源站未提供。此外，本站分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病，但数据集标题强调“非糖尿病内皮细胞”，两者之间的具体关联需依据源站完整信息判断。源站未提供相关限制说明。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息，源站未提供。用户如需引用或使用该数据集，应访问 NCBI BioProject 记录 ID 1304955 页面，查看源站发布的具体引用要求和许可声明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1304955
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
内皮功能障碍是包括糖尿病和动脉粥样硬化在内的多种血管并发症的基础。然而，长链非编码RNA（lncRNA）在其背后的作用仍知之甚少。本研究阐明了lncRNA Gm39822在健康和糖尿病条件下调控内皮功能障碍中的作用。我们的数据显示，在非糖尿病内皮细胞（ECs）中，当暴露于高糖或炎症细胞因子（TNF-a和IL-1b）时，Gm39822富集并上调。Gm39822过表达促进了非糖尿病ECs中血管细胞黏附分子-1（VCAM-1）的表达以及白细胞的黏附，但在糖尿病ECs中则无此效应。相反，沉默Gm39822降低了非糖尿病ECs中VCAM1的表达和白细胞黏附，而在糖尿病ECs中则无此作用。Gm39822缺失降低了非糖尿病ECs中炎症介质（包括p-P65、P65、P50、p-P38、P38、p-ERK1/2和ERK1/2）的表达。此外，敲低Gm39822抑制了促炎细胞因子（包括TNF-a、IL-1b和IL-6）的分泌，提示Gm39822调控EC炎症反应。
在机制上，我们鉴定出C1D——一种核富集的辅阻遏物——是Gm39822的相互作用伙伴，可能在介导Gm39822于非糖尿病内皮细胞中的功能方面发挥重要作用。总体而言，我们的结果鉴定了一种新型lncRNA Gm39822，并为内皮功能障碍的分子机制提供了见解。这些发现凸显了Gm39822作为减轻与非糖尿病内皮功能障碍相关的血管并发症的潜在治疗靶点。总体设计：在bEND.3细胞中，经核糖体去除和文库构建后，使用标准文库构建方法和Illumina HiSeq2500 V4 2x150 PE（Azenta）进行转录组RNA测序。RNA-Seq数据集包含GapmeR组和阴性对照组各4个样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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