PRJNA1285708：人类干细胞衍生胰岛与原生胰岛中细胞类型特异性缺氧反应的差异
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1285708），主题为人类干细胞衍生胰岛与原生胰岛在缺氧条件下细胞类型特异性反应的差异，属于内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病领域，主题标签为 Transcriptome or Gene expression
基本信息
资源简介
PRJNA1285708：人类干细胞衍生胰岛与原生胰岛中细胞类型特异性缺氧反应的差异
该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，编号为 PRJNA1285708，英文标题为“Divergent cell-type specific hypoxia responses in human stem cell-derived and primary islets”。其研究主题聚焦于人类干细胞衍生胰岛与原生胰岛在缺氧条件下所表现出的细胞类型特异性反应差异，归属于内分泌、营养和代谢疾病领域下的糖尿病方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。该记录汇集了与这一单一研究计划相关的多种生物数据，为用户提供统一入口以查找该项目所产生的不同类型数据，便于围绕胰岛缺氧应答机制开展转录组或基因表达层面的检索与利用。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物数据。该计划通常来自单一机构或联合体，其记录本身并不直接等同于某一种具体的数据类型，而是作为索引和入口，将围绕同一研究目标产生的多种数据关联在一起。本数据集所对应的 BioProject 记录编号为 1285708，其研究背景涉及人类干细胞衍生胰岛与原生胰岛在缺氧条件下的细胞类型特异性反应差异。该主题与内分泌、营养和代谢疾病中的糖尿病方向相关，提示其可能服务于胰岛生物学、缺氧应答以及糖尿病相关机制研究。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明该项目涉及转录组或基因表达层面的数据内容。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容与转录组或基因表达相关。项目标题明确指向人类干细胞衍生胰岛与原生胰岛在缺氧条件下细胞类型特异性反应的差异，因此其数据内容应围绕这一比较性研究展开。BioProject 记录的作用是提供单一入口，使用户能够找到该项目所产生的多种数据类型。除上述主题标签和标题所反映的内容外，源站未提供关于样本数量、测序平台、具体基因列表、分析结果或数据文件格式的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，编号为 1285708。BioProject 记录通常来自单一组织或联合体，用于汇集与单一研究计划相关的生物数据。该记录提供用户查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。除来源站和记录编号外，源站未提供关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构或联合体成员等详细信息。
【适用场景】
该数据集适用于与内分泌、营养和代谢疾病中糖尿病方向相关的研究场景，尤其是围绕胰岛在缺氧条件下细胞类型特异性反应差异的探索。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，其适用场景可包括转录组或基因表达层面的数据检索、比较分析以及相关机制研究的参考。用户可通过该 BioProject 记录查找与人类干细胞衍生胰岛和原生胰岛缺氧应答相关的多种数据类型。除上述方向外，源站未提供关于具体适用场景、推荐分析流程或目标用户群体的进一步说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 1285708 的记录，并借助该记录提供的统一入口查找与该项目相关的多种数据类型。BioProject 记录本身用于关联围绕单一研究计划产生的数据，因此使用方法应以项目记录为索引，进一步跳转或检索其关联的数据资源。除这一基本访问方式外，源站未提供关于数据下载方式、分析工具、软件环境或操作步骤的具体说明。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于项目级记录，其作用在于汇集与单一研究计划相关的生物数据并提供统一入口。源站未提供关于数据质量评估、完整性、准确性、覆盖度或技术验证的信息。由于该记录为 BioProject 条目，其本身可能不包含具体的实验数据或分析结果，用户需通过其关联链接获取更详细的数据内容。除上述说明外，源站未提供关于数据限制、使用约束或技术注意事项的进一步信息。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录编号为 1285708。源站未提供关于引用格式、许可协议、使用条款或数据共享政策的具体信息。用户如需引用或使用该数据集，应参考 NCBI BioProject 数据库的相关规定以及该记录所关联的具体数据资源所附带的引用与许可要求。除来源站和记录编号外，源站未提供其他关于引用与许可的说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1285708
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
干细胞来源胰岛（SC-islet）治疗1型糖尿病的成功受到移植后缺氧微环境中移植物存活不良的限制。尽管已有研究探讨了SC-islet对慢性缺氧的响应，但尚未在急性缺氧阶段与原发性人胰岛进行直接比较。在此，我们对暴露于急性缺氧（1% O2）48小时的人SC-islet和原代胰岛进行了比较性单细胞转录组和功能分析。我们的分析揭示了两种不同的响应模式。原代胰岛表现出能量保守型响应，抑制β细胞身份基因（PDX1、MAFA）和促凋亡因子如DDIT3，同时转向代谢静息状态。相比之下，SC-islet的响应以谱系不稳定性、向糖酵解的显著代谢转变以及促凋亡通路的激活为特征。在功能上，这些转录组差异导致两种胰岛类型均丧失葡萄糖刺激的胰岛素分泌，但机制不同：原代胰岛中分泌受到抑制，而SC-islet中则表现为失调的、对葡萄糖无反应的胰岛素释放。
这些发现表明，SC胰岛在缺氧应激下尤为脆弱，表现出不稳定且可塑的表型。这一比较数据集为开发针对特定来源的治疗干预措施提供了资源，以克服缺氧障碍并提高细胞替代疗法的疗效。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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