基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1252169：人类B细胞RNAseq/BCRseq/CITEseq

PRJNA1252169 是一个以 Homo sapiens B 细胞为研究对象的数据集，围绕 RNAseq、BCRseq 与 CITEseq 等多种技术路线展开，涵盖转录组与基因表达相关数据类型。该数据集在 NCBI 的 BioProject 体系下登记，源站标题为“Homo sapiens (ID 1252169) - BioProject - NCBI”。从数据类型来看，它同时涉及 B 细胞的基因表达信息、B 细胞受体序列信息以及表面蛋白联合检测信息，可用于 B 细胞转录组、B 细胞受体及表面蛋白的联合分析等研究场景。本站将其归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，整体上属于人类 B 细胞多组学层面的生物数据资源。

【数据集背景】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项研究计划或计划集合而组织的生物数据集合，通常由单一机构或联合体发起，其记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。PRJNA1252169 即属于此类记录，其研究对象为 Homo sapiens，聚焦于 B 细胞。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类之下，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明该数据集在主题上与转录组和基因表达研究密切相关。

【数据内容】

该数据集的核心内容围绕人类 B 细胞展开，涵盖 RNAseq、BCRseq 与 CITEseq 等数据类型。RNAseq 用于获取转录组层面的基因表达信息；BCRseq 针对 B 细胞受体序列进行测定；CITEseq 则用于联合检测转录本与表面蛋白。这些数据类型共同构成了 B 细胞在转录组、受体序列及表面蛋白层面的多维信息。主题标签“Transcriptome or Gene expression”进一步说明，基因表达相关数据是该数据集的重要组成部分。关于样本数量、测序深度、具体基因或受体序列条目等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 1252169) - BioProject - NCBI”。其登记形式为 BioProject 记录，该类记录由单一机构或联合体发起，用于汇集与某一研究计划相关的生物数据，并提供指向多种数据类型的链接。数据集英文名为 PRJNA1252169: Homo sapiens B cell RNAseq/BCRseq/CITEseq。关于具体样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者来源及机构名称等，源站未提供。

【适用场景】

根据其数据类型与主题标签，该数据集可用于 B 细胞转录组分析、B 细胞受体序列分析以及表面蛋白与基因表达联合分析等研究场景。由于同时包含 RNAseq、BCRseq 与 CITEseq，它适合用于需要从多个层面考察 B 细胞状态的研究，例如结合基因表达与受体序列特征的分析，或结合转录组与表面蛋白信息的联合分析。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类，提示其可能在该类疾病相关研究中具有应用价值。关于具体的分析流程、推荐工具或已验证的研究结论，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过该记录查找并链接到该项目所产生的多种数据类型。BioProject 的设计目的即在于为用户提供单一入口，以便获取与某一研究计划相关的各类数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、访问权限、是否需要申请授权以及配套的分析软件或流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录，其描述强调该类记录用于汇集与单一研究计划相关的生物数据并提供链接，而非直接呈现完整的实验细节或分析结果。关于数据质量评估指标、测序质量、批次效应、样本量、覆盖度、缺失情况以及使用时的注意事项，源站未提供。用户在使用时应结合原始数据记录自行判断适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1252169

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1252169

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This single-cell RNAseq/BCRseq/CITEseq dataset was collected to identify B lymphocyte changes observed in Stage 1 type 1 diabetes (T1D) individuals compared to unaffected controls

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别