phs000180:T1DGC 1型糖尿病全基因组关联研究,2008
该数据集为 dbGaP 收录的病例集(Case Set),来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究,编号 phs000180

基本信息
资源简介
phs000180:T1DGC 1型糖尿病全基因组关联研究,2008
phs000180: T1DGC: Genome-Wide Association Study in Type 1 Diabetes, 2008 是 NCBI dbGaP 收录的一项病例集(Case Set)研究,编号为 phs000180。该数据集归属于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,主题标签为 Case Set,来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究。作为 dbGaP 中的病例集资源,它围绕 1 型糖尿病的遗传关联分析而建立,可供研究者在合规前提下申请获取并用于相关遗传学研究。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
1 型糖尿病是一种由免疫介导的胰岛 β 细胞破坏所导致的代谢性疾病,遗传因素在其发病中具有重要作用。全基因组关联研究(GWAS)通过在大规模样本中检测常见遗传变异与疾病的关联,已成为解析复杂疾病遗传基础的重要策略。T1DGC(Type 1 Diabetes Genetics Consortium,1 型糖尿病遗传学联盟)于 2008 年开展了针对 1 型糖尿病的全基因组关联研究,phs000180 即为该研究在 dbGaP 中登记的病例集。该数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病,主题标签为 Case Set,表明其样本构成以病例为主,服务于病例对照或病例富集型的关联分析设计。
【数据内容】
该数据集为 dbGaP 收录的病例集(Case Set),来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究,编号 phs000180。关于样本量、具体检测平台、基因型标记数量、表型字段、随访信息及数据文件格式等细节,源站未提供。主题标签为 Case Set,提示其内容以病例样本为核心,而非一般人群队列或对照集合。由于源站描述仅标注为 dbGaP study (Case Set),未进一步说明数据层级(如原始基因型、汇总统计或派生变量),因此具体数据构成需以 dbGaP 页面实际发布内容为准。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究资源。其研究背景为 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究,编号 phs000180。关于样本采集地点、招募方式、纳入与排除标准、伦理审批信息、知情同意范围以及测序或基因分型的具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
基于其作为 1 型糖尿病全基因组关联研究病例集的性质,该数据集可用于 1 型糖尿病遗传关联分析、候选区域或全基因组范围的变异筛查、病例富集设计下的遗传效应评估,以及与其他 1 型糖尿病或自身免疫性疾病数据集的比较研究。由于主题标签为 Case Set,其在病例对照分析中通常需要配合适当的对照数据使用。关于该数据集是否适用于特定人群、特定祖源或特定临床亚型的研究,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 dbGaP 平台发布,通常需要研究者提交数据访问申请并获得相应授权后方可获取。关于具体的申请流程、访问层级(如开放访问或受控访问)、数据下载方式、配套文档(如研究方案、变量字典、分析指南)以及推荐的分析流程,源站未提供。使用者在获得数据后,应遵循 dbGaP 的数据使用条件及所在机构的伦理与合规要求。
【质量与限制】
该数据集为 dbGaP 收录的病例集,来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究。关于样本质量、基因分型质控指标、缺失率、批次效应、群体分层校正情况以及数据完整性等具体质量信息,源站未提供。作为病例集,其本身不包含或不一定包含匹配的对照组,因此在关联分析中需注意对照来源与匹配问题。此外,2008 年开展的研究在检测平台与覆盖范围上可能反映当时的技术条件,具体限制需结合源站文档评估。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台,编号为 phs000180。关于具体的引用格式、致谢要求、数据使用协议、许可条款、商业使用限制以及二次分发规定,源站未提供。使用者在发表基于该数据集的研究成果时,应按照 dbGaP 及原始研究方的要求进行引用与致谢,并遵守相应的数据共享与隐私保护规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000180
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case Set).
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




