phs000180:T1DGC 1型糖尿病全基因组关联研究,2008

该数据集为 dbGaP 收录的病例集(Case Set),来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究,编号 phs000180

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基因组分类Case Set
phs000180: T1DGC: Genome-Wide Association Study in Type 1 Diabetes, 2008

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000180:T1DGC 1型糖尿病全基因组关联研究,2008

phs000180: T1DGC: Genome-Wide Association Study in Type 1 Diabetes, 2008 是 NCBI dbGaP 收录的一项病例集(Case Set)研究,编号为 phs000180。该数据集归属于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,主题标签为 Case Set,来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究。作为 dbGaP 中的病例集资源,它围绕 1 型糖尿病的遗传关联分析而建立,可供研究者在合规前提下申请获取并用于相关遗传学研究。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

1 型糖尿病是一种由免疫介导的胰岛 β 细胞破坏所导致的代谢性疾病,遗传因素在其发病中具有重要作用。全基因组关联研究(GWAS)通过在大规模样本中检测常见遗传变异与疾病的关联,已成为解析复杂疾病遗传基础的重要策略。T1DGC(Type 1 Diabetes Genetics Consortium,1 型糖尿病遗传学联盟)于 2008 年开展了针对 1 型糖尿病的全基因组关联研究,phs000180 即为该研究在 dbGaP 中登记的病例集。该数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病,主题标签为 Case Set,表明其样本构成以病例为主,服务于病例对照或病例富集型的关联分析设计。

【数据内容】

该数据集为 dbGaP 收录的病例集(Case Set),来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究,编号 phs000180。关于样本量、具体检测平台、基因型标记数量、表型字段、随访信息及数据文件格式等细节,源站未提供。主题标签为 Case Set,提示其内容以病例样本为核心,而非一般人群队列或对照集合。由于源站描述仅标注为 dbGaP study (Case Set),未进一步说明数据层级(如原始基因型、汇总统计或派生变量),因此具体数据构成需以 dbGaP 页面实际发布内容为准。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究资源。其研究背景为 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究,编号 phs000180。关于样本采集地点、招募方式、纳入与排除标准、伦理审批信息、知情同意范围以及测序或基因分型的具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其作为 1 型糖尿病全基因组关联研究病例集的性质,该数据集可用于 1 型糖尿病遗传关联分析、候选区域或全基因组范围的变异筛查、病例富集设计下的遗传效应评估,以及与其他 1 型糖尿病或自身免疫性疾病数据集的比较研究。由于主题标签为 Case Set,其在病例对照分析中通常需要配合适当的对照数据使用。关于该数据集是否适用于特定人群、特定祖源或特定临床亚型的研究,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 dbGaP 平台发布,通常需要研究者提交数据访问申请并获得相应授权后方可获取。关于具体的申请流程、访问层级(如开放访问或受控访问)、数据下载方式、配套文档(如研究方案、变量字典、分析指南)以及推荐的分析流程,源站未提供。使用者在获得数据后,应遵循 dbGaP 的数据使用条件及所在机构的伦理与合规要求。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的病例集,来源于 T1DGC 于 2008 年开展的 1 型糖尿病全基因组关联研究。关于样本质量、基因分型质控指标、缺失率、批次效应、群体分层校正情况以及数据完整性等具体质量信息,源站未提供。作为病例集,其本身不包含或不一定包含匹配的对照组,因此在关联分析中需注意对照来源与匹配问题。此外,2008 年开展的研究在检测平台与覆盖范围上可能反映当时的技术条件,具体限制需结合源站文档评估。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台,编号为 phs000180。关于具体的引用格式、致谢要求、数据使用协议、许可条款、商业使用限制以及二次分发规定,源站未提供。使用者在发表基于该数据集的研究成果时,应按照 dbGaP 及原始研究方的要求进行引用与致谢,并遵守相应的数据共享与隐私保护规定。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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