整合单细胞与机器学习分析识别糖尿病视网膜病变铁死亡相关三基因诊断特征

该数据集包含一项关于糖尿病视网膜病变铁死亡相关诊断特征研究的处理数据与分析脚本,覆盖人增殖性糖尿病视网膜病变纤维血管膜的单细胞RNA-seq分析、基于机器学习的三基因诊断特征识别、多队列与跨物种验证、FTH1表达的多数据库验证,以及铁死亡与代谢通路GSVA、配体-靶点NicheNet和转录因子活性D

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基因组分类OphthalmologyDiabetic retinopathyFerroptosisSingle-cell transcriptomicsMachine learningDiagnostic modelMulti-cohort validation
Integrative single-cell and machine learning analysis identifies a ferroptosis-related three-gene diagnostic signature for diabetic retinopathy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

整合单细胞与机器学习分析识别糖尿病视网膜病变铁死亡相关三基因诊断特征

Integrative single-cell and machine learning analysis identifies a ferroptosis-related three-gene diagnostic signature for diabetic retinopathy

该数据集包含一项关于糖尿病视网膜病变铁死亡相关诊断特征研究的处理数据与分析脚本,覆盖人增殖性糖尿病视网膜病变纤维血管膜的单细胞RNA-seq分析、基于机器学习的三基因诊断特征识别、多队列与跨物种验证、FTH1表达的多数据库验证,以及铁死亡与代谢通路GSVA、配体-靶点NicheNet和转录因子活性DoRothEA+VIPER分析,可用于糖尿病视网膜病变诊断标志物与机制研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含研究“整合单细胞与机器学习分析识别糖尿病视网膜病变铁死亡相关三基因诊断特征”的处理数据和分析脚本。数据集包括:1. 人PDR纤维血管膜的单细胞RNA-seq分析(GSE165784)2. 基于机器学习的三基因诊断特征识别(FTH1、LDHA、CTSZ)3. 多队列验证(GSE102485、GSE160306、GSE60436)4. 大鼠STZ诱导DR的跨物种验证(GSE209872)5. FTH1表达的多数据库验证(GTEx v8、HPA)6. 铁死亡与代谢通路的GSVA分析7. 配体-靶点相互作用的NicheNet分析8. 转录因子活性的DoRothEA + VIPER分析

【主题与分类】

主题标签:Ophthalmology、Diabetic retinopathy、Ferroptosis、Single-cell transcriptomics、Machine learning、Diagnostic model、Multi-cohort validation。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。

【获取与许可】

源站页面:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=3be2b927a2a741ce9522094492b89797

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含研究《整合单细胞与机器学习分析识别糖尿病视网膜病变的铁死亡相关三基因诊断特征》的处理数据和分析脚本。数据集包括:1. 人PDR纤维血管膜的单细胞RNA-seq分析(GSE165784)2. 基于机器学习的三个基因诊断特征识别(FTH1、LDHA、CTSZ)3. 多队列验证(GSE102485、GSE160306、GSE60436)4. 大鼠STZ诱导DR的跨物种验证(GSE209872)5. FTH1表达的多数据库验证(GTEx v8、HPA)6. 铁死亡与代谢通路的GSVA分析7. 配体-靶点相互作用的NicheNet分析8. 转录因子活性的DoRothEA + VIPER分析

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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