Harmonia整合GWAS汇总统计——生殖与产科结局：多囊卵巢综合征、妊娠期糖尿病、子宫内膜异位症及月经特征（第2部分，共2部分）
该数据集为 Harmonia 协调后的 GWAS 汇总统计，覆盖生殖与产科结局这一性状类别，包括多囊卵巢综合征、妊娠糖尿病、子宫内膜异位症、初潮与绝经年龄及子女数量，共纳入 7 项公开研究（第 2 部分，共 2 部分）
基本信息
资源简介
Harmonia整合GWAS汇总统计——生殖与产科结局：多囊卵巢综合征、妊娠期糖尿病、子宫内膜异位症及月经特征（第2部分，共2部分）
Harmonia harmonized GWAS summary statistics — Reproductive and obstetric outcomes: PCOS, gestational diabetes, endometriosis, and menstrual traits (part 2 of 2)
该数据集为 Harmonia 协调后的 GWAS 汇总统计，覆盖生殖与产科结局这一性状类别，包括多囊卵巢综合征、妊娠糖尿病、子宫内膜异位症、初潮与绝经年龄及子女数量，共纳入 7 项公开研究（第 2 部分，共 2 部分）。文件经 Harmonia v1.5.0 处理，生成 COJO 与 LD-score 回归格式输出，每个研究归档同时提供 GRCh38/hg38 主构建与 GRCh37/hg19 liftover 构建，并附 manifest 文件列出研究、性状、祖源、构建、样本量、PMID 及变异数。数据仅含允许公开再分发许可的研究，可用于相关性状的遗传关联分析与方法学再利用（来源 DOI 解析，Creative Commons A。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含经协调的 GWAS 汇总统计，覆盖 7 项公开研究，涉及一个性状类别：生殖与产科结局——多囊卵巢综合征、妊娠糖尿病、子宫内膜异位症、初潮与绝经年龄以及子女数量（第 2 部分，共 2 部分）。文件使用 Harmonia v1.5.0（ 10.5281/zenodo.21420283）处理，该工具协调 GWAS 汇总统计并生成 COJO 和 LD-score 回归格式的输出。每个研究归档（.tar.gz）包含 GRCh38/hg38（主）和 GRCh37/hg19（b37，通过 liftover）两种构建的输出。清单文件（manifest_upload14.tsv）列出所有纳入研究及其性状名称、祖源、构建、样本量、PMID、COJO 变异数和 LDSC 变异数。仅纳入具有宽松公开再分发许可的研究；受数据使用协议约束的研究……
【主题与分类】
主题标签：GWAS summary statistics。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23054778
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23054778
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 35.79 GB。
数据说明
本数据集包含7项公开研究的协调后GWAS汇总统计数据，涵盖一个性状类别：生殖与产科结局——多囊卵巢综合征、妊娠期糖尿病、子宫内膜异位症、月经初潮与绝经年龄以及子女数量（第2部分，共2部分）。文件使用Harmonia v1.5.0（https://github.com/CirculatoryHealth/Harmonia；DOI：10.5281/zenodo.21420283）处理，该工具可协调GWAS汇总统计数据并生成COJO和LD-score回归格式的输出。每个按研究分组的归档文件（.tar.gz）均包含GRCh38/hg38（主要）和GRCh37/hg19（b37，通过liftover转换）两种构建版本的输出。清单文件（manifest_upload14.tsv）列出了所有纳入研究及其性状名称、 ancestry、构建版本、样本量、PMID、COJO变异数和LDSC变异数。仅纳入具有宽松公开再分发许可的研究；受数据使用协议约束或访问受限的研究被排除。本数据集是Zenodo系列上传的一部分，该系列涵盖116项使用Harmonia处理的GWAS汇总统计数据。
随附的软件论文为：van der Laan SW 等，Harmonia：一套用于将 GWAS 汇总统计量统一为标准化格式的工具套件。F1000Research (2026)。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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