SLC22A1 (OCT1) 变异与孟加拉国原住民2型糖尿病患者二甲双胍血糖反应差异数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22933043

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集支持研究“SLC22A1 (OCT1) 变异与孟加拉国原住民2型糖尿病成人患者二甲双胍血糖反应相关的基因型差异：一项综合药物遗传学和计算机模拟研究”。该存储库包含去标识化的参与者级别临床和药物基因组学数据、主要手稿图表、基因分型凝胶和Sanger测序记录、支持信息、分子对接和PLIP相互作用数据、分子动力学轨迹分析以及MD后MM-GBSA结果。该研究纳入了103名来自孟加拉国吉大港山区原住民社区的新诊断、既往未治疗的2型糖尿病成人患者，在开始二甲双胍治疗后随访三个月。该研究评估了SLC22A1 rs628031 (M408V) 和rs12208357 (R61C)。临床分析检查了血糖反应的基因型相关差异，而计算分析包括OCT1结构建模、分子对接、蛋白质-配体相互作用分析、100纳秒分子动力学模拟以及MD后MM-GBSA分析。

该资源库按文件夹组织，包含主图、基因分型和Sanger数据、支持信息、计算原始数据以及伦理/研究文件，还有去标识化的参与者数据集。资源库内附有一个README文件，描述了资源库结构及各个文件。参与者数据已准备用于研究共享，不含直接的个人姓名。用户不应试图重新识别参与者，也不应将这些数据与外部信息结合以进行重新识别。计算对接和MM-GBSA值应被解释为比较性估计，而非OCT1转运或结合亲和力的直接实验测量。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。