全基因组功能基因组学方法揭示1型糖尿病免疫表型的遗传决定因素

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A6656d6a34a864d1fd7e8b459ffda25bf8be00152c0a44d9bdcc55df4cfd4dbf3

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：免疫细胞组成和功能的个体间巨大差异总体上决定了免疫反应，尤其是对免疫介导疾病的易感性。尽管关于1型糖尿病(T1D)相关遗传变异已有较多了解，但这些变异发挥作用的病理生理机制仍不清楚。方法：收集了243名荷兰裔T1D患者的血液样本。我们对超过200种免疫细胞特征和超过100种刺激后的细胞因子产生谱进行了遗传关联分析，以识别免疫功能的遗传决定因素，并将T1D患者中获得的结果与健康对照组进行比较。结果：决定T1D易感性的遗传变异显著影响T细胞组成。具体而言，CCR5+调节性T细胞通过CCR区域与T1D相关联，提示存在共同的遗传调控。

全基因组数量性状位点(QTL…，该QTL数据集是通过将免疫表型(细胞比例及刺激后的细胞因子产生)映射到健康供体(500FG)或1型糖尿病患者(300DM)上生成的。所有供体信息均已匿名处理。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。