溃疡性结肠炎与储袋炎肠道微生物组和转录组变化识别数据集
该数据集包含溃疡性结肠炎和储袋炎患者的肠道微生物组（16S核糖体DNA测序数据）和转录组数据，整合了粪便样本的微生物群落分析与宿主基因表达信息，主要用于比较两种疾病在微生物组成、基因表达及免疫反应方面的差异，支持炎症性肠病的发病机制研究和生物标志物发现。
创建时间2022-03-11
更新时间2022-03-11
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Identification_of_gut_microbiome_and_transcriptome_changes_in_ulcerative_colitis_and_pouchitis/19349237
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资源简介
该数据集旨在研究溃疡性结肠炎（UC）及其术后并发症储袋炎的微生物组和转录组差异。数据集包含来自85名参与者（37名UC患者、15名健康UC储袋者、15名储袋炎患者和18名健康志愿者）的粪便样本，通过16S核糖体DNA焦磷酸测序分析微生物群落。同时，整合了来自两个数据集的119名UC患者和28名储袋炎患者的转录组数据，用于生物信息学分析。研究发现，随着UC病情加重，肠道微生物多样性及丁酸盐产生菌和拟杆菌数量逐渐减少；储袋炎中则观察到益生菌减少、大肠杆菌-志贺氏菌和Ruminococcus gnavus增殖，且与多种感染途径相关。转录组分析揭示了UC和储袋炎在差异表达基因、枢纽基因及免疫状态上的区别：UC表现出更强的免疫反应，可能与肿瘤坏死因子和白细胞介素高表达有关；而储袋炎中如CDK1等枢纽基因则与细胞周期调控相关。该数据集适用于炎症性肠病的发病机制研究、微生物组与宿主转录组互作分析以及相关生物标志物探索。
提供机构：Li, Kai-Yu; Huang, Di; Yang, Li-Sheng; Liu, Tong; Gao, Xin; He, An-Qi; Liu, Gang
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