肠梗阻与Cajal间质细胞基因-疾病关联数据集

该数据集来自 scielo.figshare.com,配套论文研究机械性肠梗阻对大鼠Cajal间质细胞表型的影响。实验将健康Wistar大鼠随机分为假手术组及梗阻1天、2天、3天组,每组10只,采用RT-PCR和免疫组化检测肠道组织SCF mRNA与c-Kit蛋白表达

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2024-02-06 更新
浏览 6
基因组回归Intestinal obstructionInterstitial cells of CajalStem cell factorc-Kit protein
Intestinal obstruction — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
基因组
大小
0.000005632 GB
任务类型
回归
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-02-06
版本
v1

资源简介

肠梗阻与Cajal间质细胞基因-疾病关联数据集

Phenotypic changes of interstitial cells of Cajal after intestinal obstruction in rat model

该数据集来自 scielo.figshare.com,配套论文研究机械性肠梗阻对大鼠Cajal间质细胞表型的影响。实验将健康Wistar大鼠随机分为假手术组及梗阻1天、2天、3天组,每组10只,采用RT-PCR和免疫组化检测肠道组织SCF mRNA与c-Kit蛋白表达。数据以Table_1.xls单文件形式提供,可用于肠梗阻进程中ICC表型变化相关基因-疾病关联分析与表达趋势研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Phenotypic changes of interstitial cells of Cajal after intestinal obstruction in rat model》发表于 Brazilian Journal of Medical and Biological Research(2019),DOI:10.1590/1414-431x20198343。源站首次发布:2022-06-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在探讨机械性肠梗阻对大鼠Cajal间质细胞(ICC)表型的影响。健康Wistar大鼠随机分为假手术组(C)、梗阻一天组(M1)、梗阻两天组(M2)和梗阻三天组(M3),每组10只。采用RT-PCR和免疫组化法检测肠道组织中SCF mRNA和c-Kit蛋白的表达。与假手术组相比,两个梗阻组肠道组织中SCF mRNA的相对表达量和c-Kit蛋白的表达量均显著降低。水平随梗阻时间延长逐渐下降,梗阻后第3天显著降低(P<0.05)。小肠免疫组化染色显示,假手术组ICC数量

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 5.63 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19962633.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Microbiology not elsewhere classified。主题标签:Intestinal obstruction、Interstitial cells of Cajal、Stem cell factor、c-Kit protein。本站分类:消化系统疾病/肠梗阻。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Phenotypic_changes_of_interstitial_cells_of_Cajal_after_intestinal_obstruction_in_rat_model/19962633

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Li, Lin; Zou, Changlin; Zhou, Zhenli; Wang, Ximo; Yu, Xiangyang (2019). Phenotypic changes of interstitial cells of Cajal after intestinal obstruction in rat model. SciELO journals. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-02-06,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/35532480"

文件清单

  • Table_1.xls(5.63 KB)

文件总体积 5.63 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

本研究旨在探讨机械性肠梗阻对大鼠肠道Cajal间质细胞(ICC)表型的影响。健康Wistar大鼠随机分为假手术组©、梗阻1天组(M1)、梗阻2天组(M2)和梗阻3天组(M3),每组10只。采用RT-PCR和免疫组化法检测肠道组织中SCF mRNA和c-Kit蛋白的表达。与假手术组相比,各梗阻组肠道组织中SCF mRNA相对表达量和c-Kit蛋白表达量均显著降低,且随梗阻时间延长逐渐降低,梗阻后第3天显著降低(P<0.05)。小肠免疫组化染色显示,假手术组ICC数量最多,M1至M3组随梗阻时间延长逐渐减少,组间差异有统计学意义(P<0.05)。肠梗阻导致ICC中SCF mRNA和c-Kit蛋白浓度降低。

随着肠梗阻时间的延长,ICC的数量逐渐减少。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.19962633.v1(source: https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Phenotypic_changes_of_interstitial_cells_of_Cajal_after_intestinal_obstruction_in_rat_model/19962633)。

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