利用定量（磷酸化）蛋白质组学和MALDI质谱成像鉴定人肠道缺血再灌注诱导的蛋白质变化
Juan Manuel Valverde，利用定量（磷酸化）蛋白质组学和MALDI质谱成像鉴定人肠道缺血再灌注诱导的蛋白质变化[数据集]
基本信息
资源简介
利用定量（磷酸化）蛋白质组学和MALDI质谱成像鉴定人肠道缺血再灌注诱导的蛋白质变化
该数据集题为“Identification of ischemia-reperfusion induced protein changes in human intestine using quantitative (phospho)proteomics and MALDI mass spectrometry imaging”，由 Juan Manuel Valverde 提交，收录于 ebi.ac.uk（PRIDE Archive，项目编号 PXD026076）。数据集聚焦消化系统疾病中的肠缺血问题，围绕人肠道在缺血再灌注条件下发生的蛋白质变化展开，采用定量（磷酸化）蛋白质组学与 MALDI 质谱成像相结合的研究策略，从蛋白质丰度与空间分布两个层面刻画缺血再灌注诱导的分子改变。该数据集为肠缺血再灌注损伤相关研究提供了以人类肠道组织为对象的蛋白质组学数据资源，可供关注消化系统疾病分子机制的研究者参考与再利用。
【数据集背景】
肠缺血再灌注是消化系统疾病领域的重要病理过程，指肠道组织在血流中断后恢复供血时引发的进一步损伤。该数据集以人肠道为研究对象，旨在鉴定缺血再灌注诱导的蛋白质变化，属于以蛋白质组学手段解析肠缺血分子机制的实验型数据集。数据集标题明确将定量（磷酸化）蛋白质组学与 MALDI 质谱成像并列，说明研究同时关注蛋白质及其磷酸化修饰的定量变化与组织空间分布信息。
【数据内容】
依据源站描述，该数据集的核心内容为缺血再灌注诱导的人肠道蛋白质变化，涵盖定量蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学以及 MALDI 质谱成像所获得的数据。数据集名称中的“quantitative (phospho)proteomics”表明定量分析与磷酸化修饰分析是数据的重要组成部分；“MALDI mass spectrometry imaging”则表明数据包含质谱成像层面的信息。关于具体样本数量、蛋白质鉴定数目、磷酸化位点数目及成像切片数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 PRIDE Archive，项目编号为 PXD026076，提交者为 Juan Manuel Valverde。数据以人类肠道组织为研究对象，围绕缺血再灌注处理条件下的蛋白质变化进行采集。除上述来源与研究对象信息外，关于样本采集地点、供体信息、伦理审批及实验流程等具体内容，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肠缺血再灌注损伤相关的基础与转化研究场景，例如探讨缺血再灌注过程中蛋白质丰度与磷酸化修饰的变化、结合质谱成像观察分子在肠道组织中的空间分布特征，以及作为人肠道蛋白质组学研究的参考数据。对于消化系统疾病领域关注肠缺血分子机制的研究者，该数据集可作为数据再利用与比较分析的候选资源。具体适用条件需结合源站说明判断，源站未提供更详细的适用建议。
【使用方法】
该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE Archive 项目页面（https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026076）发布，使用者可依据该页面获取数据集及相关说明。关于数据文件格式、下载方式、分析软件与参数设置等具体使用指引，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为基于人肠道样本的蛋白质组学与质谱成像数据集，其质量信息（如鉴定置信度、定量重复性、成像分辨率等）源站未提供。使用时应注意到数据集聚焦于缺血再灌注诱导的蛋白质变化这一特定主题，样本与实验条件的具体范围以源站描述为准；除此之外的限制说明源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参考源站给出的描述：Juan Manuel Valverde, Identification of ischemia-reperfusion induced protein changes in human intestine using quantitative (phospho)proteomics and MALDI mass spectrometry imaging [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026076。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026076
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Juan Manuel Valverde, Identification of ischemia-reperfusion induced protein changes in human intestine using quantitative (phospho)proteomics and MALDI mass spectrometry imaging [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026076
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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