MGYS00005791:EMG生成的PRJNA385949数据集TPA宏基因组组装(IBD患者与对照的纵向粪便研究)

主题标签:宏基因组、鸟枪法测序、序列组装、粪便菌群、炎症性肠病、消化系统疾病、纵向分析、第三方注释。本站分类:消化系统疾病/炎症性肠病

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基因组分类宏基因组鸟枪法测序序列组装粪便菌群炎症性肠病消化系统疾病纵向分析第三方注释
MGYS00005791: EMG produced TPA metagenomics assembly of PRJNA385949 data set (Longitudinal Stool Study of patients with IBD and controls).

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

MGYS00005791:EMG生成的PRJNA385949数据集TPA宏基因组组装(IBD患者与对照的纵向粪便研究)

主题标签:宏基因组、鸟枪法测序、序列组装、粪便菌群、炎症性肠病、消化系统疾病、纵向分析、第三方注释。本站分类:消化系统疾病/炎症性肠病

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):第三方注释(Third Party Annotation,TPA)组装体源自原始全基因组鸟枪法(WGS)数据集 PRJNA385949,并使用 metaSPAdes v3.12.0 组装。该项目包含来自以下生物群系的样本:root:Host-associated:Human:Digestive system:Large intestine:Fecal。

【主题与分类】

主题标签:宏基因组、鸟枪法测序、序列组装、粪便菌群、炎症性肠病、消化系统疾病、纵向分析、第三方注释。本站分类:消化系统疾病/炎症性肠病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/metagenomics/studies/MGYS00005791

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

第三方注释(Third Party Annotation,TPA)组装体源自原始全基因组鸟枪法(WGS)数据集 PRJNA385949,并使用 metaSPAdes v3.12.0 组装。该项目包含来自以下生物群系的样本:root:Host-associated:Human:Digestive system:Large intestine:Fecal。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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