急性放射性食管炎严重程度与肠道菌群特征关联数据集

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一项关于急性放射性食管炎(ARIE)与肠道菌群特征关联研究的数据文件

google_dataset
2023-06-15 更新
浏览 2
医学影像预测acute radiation-induced esophagitisgut microbiotaesophageal cancerradiotherapy16S rRNA gene
Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000039521 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-15
版本
v1

资源简介

急性放射性食管炎严重程度与肠道菌群特征关联数据集

Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一项关于急性放射性食管炎(ARIE)与肠道菌群特征关联研究的数据文件。研究采集接受放疗(n=7)或同步放化疗(n=42)的食管癌患者放疗开始、中期和结束时的肠道菌群样本,并进行患者报告的ARIE评估,基于16S rRNA基因测序分析治疗期间肠道微生物群落变化及其与ARIE严重程度的相关性。数据可用于探索肠道菌群特征与ARIE严重程度的关联,为预测ARIE严重程度提供基础(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Gut Microbiota-Derived l-Histidine/Imidazole Propionate Axis Fights against the Radiation-Induced Cardiopulmonary Injury》发表于 International Journal of Molecular Sciences(2021),DOI:10.3390/ijms222111436。源站首次发布:2022-06-09。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:急性放射性食管炎(ARIE)是接受胸部放疗患者中最令人衰弱的并发症之一,尤其是食管癌(EC)患者。关于肠道菌群特征对ARIE发生和严重程度的影响知之甚少。材料与方法:在放疗方案开始、中期和结束时收集接受放疗(n=7)或同步放化疗(n=42)的EC患者的肠道菌群样本。同时进行患者报告的ARIE评估。基于16S rRNA基因测序,研究治疗期间肠道微生物群落的变化以及肠道菌群特征与ARIE严重程度的相关性。结果:肠道菌群的若干特性与ARIE严重程度存在显著关联。该关联

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 39.52 KB。数据集 DOI:10.3389/fmicb.2022.883650.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。主题标签:acute radiation-induced esophagitis、gut microbiota、esophageal cancer、radiotherapy、16S rRNA gene。本站分类:消化系统疾病/食管炎。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Gut_Microbiota_Characteristics_Are_Associated_With_Severity_of_Acute_Radiation-Induced_Esophagitis_zip/20033807

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Lin, Ming-qiang; Wu, Ya-hua; Yang, Jun; Lin, Han-cui; Liu, Ling-yun; Yu, Yi-lin; et al. (2022). Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-15,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/35782448"

文件清单

  • Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip(39.52 KB)

文件总体积 39.52 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景:急性放射性食管炎(ARIE)是接受胸部放疗患者中最令人衰弱的并发症之一,尤其是食管癌(EC)患者。目前关于肠道菌群特征对ARIE发生及严重程度的影响知之甚少。材料与方法:收集接受放疗(n=7)或同步放化疗(n=42)的EC患者在放疗方案开始、中期和结束时肠道菌群样本,同时进行患者报告的ARIE评估。基于16S rRNA基因测序,研究治疗期间肠道微生物群落的变化以及肠道菌群特征与ARIE严重程度的相关性。结果:肠道菌群的若干特性与ARIE严重程度存在显著关联。随着黏膜炎严重程度增加,变形菌门中几个属的相对丰度显著增加。优势属在治疗期间具有特征性变化,例如包括链球菌在内的条件致病菌增加。

重度ARIE患者在放疗前的α多样性显著较低,且Fusobacterium丰度较高,而轻度ARIE患者则富集Klebsiella、Roseburia、Veillonella、Prevotella_9、Megasphaera和Ruminococcus_2。结合这些菌属的模型在预测重度ARIE方面表现最佳(曲线下面积:0.907)。结论:放疗前的肠道菌群特征与后续ARIE严重程度相关。基于菌群的策略在早期预测后续ARIE以及筛选可能预防重度ARIE的干预措施方面具有潜在应用价值。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fmicb.2022.883650.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Gut_Microbiota_Characteristics_Are_Associated_With_Severity_of_Acute_Radiation-Induced_Esophagitis_zip/20033807)。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案