急性放射性食管炎严重程度与肠道菌群特征关联数据集
该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一项关于急性放射性食管炎(ARIE)与肠道菌群特征关联研究的数据文件

基本信息
资源简介
急性放射性食管炎严重程度与肠道菌群特征关联数据集
Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip
该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一项关于急性放射性食管炎(ARIE)与肠道菌群特征关联研究的数据文件。研究采集接受放疗(n=7)或同步放化疗(n=42)的食管癌患者放疗开始、中期和结束时的肠道菌群样本,并进行患者报告的ARIE评估,基于16S rRNA基因测序分析治疗期间肠道微生物群落变化及其与ARIE严重程度的相关性。数据可用于探索肠道菌群特征与ARIE严重程度的关联,为预测ARIE严重程度提供基础(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Gut Microbiota-Derived l-Histidine/Imidazole Propionate Axis Fights against the Radiation-Induced Cardiopulmonary Injury》发表于 International Journal of Molecular Sciences(2021),DOI:10.3390/ijms222111436。源站首次发布:2022-06-09。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:急性放射性食管炎(ARIE)是接受胸部放疗患者中最令人衰弱的并发症之一,尤其是食管癌(EC)患者。关于肠道菌群特征对ARIE发生和严重程度的影响知之甚少。材料与方法:在放疗方案开始、中期和结束时收集接受放疗(n=7)或同步放化疗(n=42)的EC患者的肠道菌群样本。同时进行患者报告的ARIE评估。基于16S rRNA基因测序,研究治疗期间肠道微生物群落的变化以及肠道菌群特征与ARIE严重程度的相关性。结果:肠道菌群的若干特性与ARIE严重程度存在显著关联。该关联
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 39.52 KB。数据集 DOI:10.3389/fmicb.2022.883650.s001。
【主题与分类】
源站学科分类:Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。主题标签:acute radiation-induced esophagitis、gut microbiota、esophageal cancer、radiotherapy、16S rRNA gene。本站分类:消化系统疾病/食管炎。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。
【获取与许可】
源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Gut_Microbiota_Characteristics_Are_Associated_With_Severity_of_Acute_Radiation-Induced_Esophagitis_zip/20033807
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Lin, Ming-qiang; Wu, Ya-hua; Yang, Jun; Lin, Han-cui; Liu, Ling-yun; Yu, Yi-lin; et al. (2022). Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-15,引用时请注意版本时效。
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip
- DOI:10.3389/fmicb.2022.883650.s001
- 发布日期:2022-06-09
- 文件数:1 个
- 文件总体积:39.52 KB
- 源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Gut_Microbiota_Characteristics_Are_Associated_With_Severity_of_Acute_Radiation-Induced_Esophagitis_zip/20033807
命令行下载
curl -L -o "Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/35782448"
文件清单
Data_Sheet_1_Gut Microbiota Characteristics Are Associated With Severity of Acute Radiation-Induced Esophagitis.zip(39.52 KB)
文件总体积 39.52 KB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
背景:急性放射性食管炎(ARIE)是接受胸部放疗患者中最令人衰弱的并发症之一,尤其是食管癌(EC)患者。目前关于肠道菌群特征对ARIE发生及严重程度的影响知之甚少。材料与方法:收集接受放疗(n=7)或同步放化疗(n=42)的EC患者在放疗方案开始、中期和结束时肠道菌群样本,同时进行患者报告的ARIE评估。基于16S rRNA基因测序,研究治疗期间肠道微生物群落的变化以及肠道菌群特征与ARIE严重程度的相关性。结果:肠道菌群的若干特性与ARIE严重程度存在显著关联。随着黏膜炎严重程度增加,变形菌门中几个属的相对丰度显著增加。优势属在治疗期间具有特征性变化,例如包括链球菌在内的条件致病菌增加。
重度ARIE患者在放疗前的α多样性显著较低,且Fusobacterium丰度较高,而轻度ARIE患者则富集Klebsiella、Roseburia、Veillonella、Prevotella_9、Megasphaera和Ruminococcus_2。结合这些菌属的模型在预测重度ARIE方面表现最佳(曲线下面积:0.907)。结论:放疗前的肠道菌群特征与后续ARIE严重程度相关。基于菌群的策略在早期预测后续ARIE以及筛选可能预防重度ARIE的干预措施方面具有潜在应用价值。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fmicb.2022.883650.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Gut_Microbiota_Characteristics_Are_Associated_With_Severity_of_Acute_Radiation-Induced_Esophagitis_zip/20033807)。
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