痤疮丙酸杆菌生物膜形成临床分离株改变金黄色葡萄球菌生物膜形成与结构并增加其抗生素敏感性
痤疮丙酸杆菌（曾称 Propionibacterium acnes）常在外科器械相关感染中被检出，也常与其他机会致病菌从感染部位共同分离
基本信息
资源简介
痤疮丙酸杆菌生物膜形成临床分离株改变金黄色葡萄球菌生物膜形成与结构并增加其抗生素敏感性
PRJNA784927 数据集围绕痤疮丙酸杆菌（Cutibacterium acnes，曾称 Propionibacterium acnes）与金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）生物膜之间的相互作用展开。痤疮丙酸杆菌常在外科器械相关感染中被检出，也常与其他机会致病菌从感染部位共同分离。该数据集来自 ebi.ac.uk，本站将其归类于消化系统疾病 / 其他。数据集名称直接指向其研究主题：形成生物膜的痤疮丙酸杆菌临床分离株会改变金黄色葡萄球菌生物膜的形成与结构，并提高其对抗生素的敏感性。整体而言，该数据集记录了对 100 株来自人体不同感染部位（包括深部组织和浅表部位）的临床痤疮丙酸杆菌分离株的生物膜形成能力研究，以及这些菌株培养上清液如何影响金黄色葡萄球菌 NCTC 6571 生物膜的附着与成熟。
【数据集背景】
痤疮丙酸杆菌经常在外科器械相关感染中被发现，并且常与其他机会致病菌从感染部位共同分离。已有研究显示，痤疮丙酸杆菌能够形成生物膜；当它与葡萄球菌属共培养时，不同研究报道了抑制和刺激两种相反的效果。基于这一背景，该数据集所对应的研究旨在考察来自人体不同感染部位的临床痤疮丙酸杆菌分离株的生物膜形成能力，并进一步探究痤疮丙酸杆菌培养上清液对金黄色葡萄球菌 NCTC 6571 生物膜附着和成熟的影响。
【数据内容】
该数据集涉及 100 株临床痤疮丙酸杆菌分离株，这些菌株来自人体多种感染部位，既包括深部组织，也包括浅表部位。研究检测了所有分离株在体外形成生物膜的能力，结果显示所有痤疮丙酸杆菌分离株均能在体外形成生物膜，但不同分离株之间的生物膜生物量存在差异。其中，19 株为弱黏附，33 株为中等黏附。数据集还涉及痤疮丙酸杆菌培养上清液对金黄色葡萄球菌 NCTC 6571 生物膜附着与成熟的影响。关于其余分离株的黏附程度分类、具体的生物膜生物量数值、上清液影响的具体实验结果，以及抗生素敏感性变化的具体数据，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。研究样本为来自人体感染部位的临床痤疮丙酸杆菌分离株，共 100 株，感染部位涵盖深部组织和浅表部位。研究中使用的金黄色葡萄球菌菌株为 NCTC 6571。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及原始数据的具体提交信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究痤疮丙酸杆菌与金黄色葡萄球菌之间的生物膜相互作用，尤其是临床分离株的生物膜形成能力差异，以及痤疮丙酸杆菌培养上清液对金黄色葡萄球菌生物膜附着和成熟的影响。它也可用于关注外科器械相关感染、机会致病菌共感染、生物膜相关抗生素敏感性变化等方向的研究。关于该数据集在其他具体场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具等信息。
【质量与限制】
该数据集所对应的研究显示，所有痤疮丙酸杆菌分离株均能在体外形成生物膜，但生物膜生物量在不同分离株之间存在差异，其中 19 株为弱黏附，33 株为中等黏附。关于其余分离株的分类、实验重复次数、统计分析方法、数据完整性以及潜在偏差等质量与限制信息，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA784927
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
痤疮丙酸杆菌（正式名称为痤疮丙酸杆菌）常在外科器械相关感染中被检出，且常与其他机会性病原体从感染部位共同分离。近期研究表明，痤疮丙酸杆菌能够形成生物膜，并且当与葡萄球菌属共培养时，多项研究报告了抑制和刺激两种效应。在此，我们研究了从人类患者不同感染部位（包括深部组织和浅表组织）分离的100株临床痤疮丙酸杆菌分离株的生物膜形成能力，随后探究了痤疮丙酸杆菌培养上清液如何影响金黄色葡萄球菌NCTC 6571生物膜的附着和成熟。所有痤疮丙酸杆菌分离株均能在体外形成生物膜，尽管生物膜生物量在分离株之间存在差异。19株分离株为弱黏附，33株为中度黏附，大多数（48株）表现出强黏附。痤疮丙酸杆菌无菌上清液的存在降低了金黄色葡萄球菌培养物的生物量，在几种痤疮丙酸杆菌分离株存在下观察到降低超过90%。我们观察到这种降低并非由于痤疮丙酸杆菌影响金黄色葡萄球菌
金黄色葡萄球菌的存活率，也不是由于丙酸的存在。然而，生物膜成熟在24小时内被延迟，生物膜表面结构也是如此，尽管初期（长达8小时）的表面附着未受影响。我们假设这种缺陷的生物膜成熟是观察到的生物量减少的原因。反过来，这些改变了的生物膜对抗生素治疗表现出更高的敏感性。相比之下，在浮游状态（定义为液柱内自由移动、非表面附着的群体）的金黄色葡萄球菌培养物中，痤疮丙酸杆菌上清液的存在通过目前尚未明确的机制增加了抗生素耐受性。这项研究表明，在定植和感染事件中，痤疮丙酸杆菌与其他机会性病原体之间可能存在复杂的相互作用。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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