中国某三级医院多重耐药菌监测(2017-2026):去标识记录级检测数据与分析代码

该数据集来自中国某三级医院2017年5月至2026年8月的回顾性队列,包含3,031条记录级多重耐药菌检测数据(57个字段,涵盖病区、病原体、耐药表型、标本、时间戳、感染状态和风险因素),以及1,576个住院发作的结局与发作级风险因素

ZenodoZenodo
datacite
浏览 11
文本预测multidrug-resistant organismsantimicrobial resistancehospital surveillanceinfection controlcompeting riskshospital epidemiology
Multidrug-resistant organism surveillance in a Chinese tertiary hospital (2017-2026): de-identified record-level detection data and analysis code

基本信息

模态
文本
大小
0.000347034 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

中国某三级医院多重耐药菌监测(2017-2026):去标识记录级检测数据与分析代码

Multidrug-resistant organism surveillance in a Chinese tertiary hospital (2017-2026): de-identified record-level detection data and analysis code

该数据集来自中国某三级医院2017年5月至2026年8月的回顾性队列,包含3,031条记录级多重耐药菌检测数据(57个字段,涵盖病区、病原体、耐药表型、标本、时间戳、感染状态和风险因素),以及1,576个住院发作的结局与发作级风险因素。配套提供数据清洗日志、可复现所有报告数字的Python脚本和变量定义说明。关键结果提示首次检测时为感染(而非定植)与院内死亡独立相关。数据可用于MDRO监测、感染控制评估及竞争风险生存分析建模(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):中国某三级医院多重耐药菌(MDRO)检测回顾性队列(2017年5月至2026年8月)的去标识监测数据集与完整分析代码。文件包括:01_cleaned_MDRO_surveillance_dataset_record_level.csv(3,031条记录级MDRO检测,57个字段:病区、病原体、耐药表型、标本、时间戳、感染状态、风险因素);02_episode_level_analysis_dataset.csv(1,576个住院发作,含结局与发作级风险因素);00_cleaning_log.json(数据清洗审计轨迹);code/(可复现每个报告数字的Python脚本);README.md(变量定义、去标识声明、运行顺序与关键结果)。关键结果:首次MDRO检测时为感染(相对于定植)与院内死亡独立相关(校正Fine-Gray亚分布风险比2.62,95% C

【主题与分类】

主题标签:multidrug-resistant organisms、antimicrobial resistance、hospital surveillance、infection control、competing risks、hospital epidemiology。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23856874

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.23856874

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 347.0 KB。

数据说明

中国某三级医院多重耐药菌(MDRO)检出回顾性队列(2017年5月—2026年8月)的去标识化监测数据集及完整分析代码。文件包括:01_cleaned_MDRO_surveillance_dataset_record_level.csv(3,031条记录级MDRO检出,57个字段:病房、病原体、耐药表型、标本、时间戳、感染状态、危险因素);02_episode_level_analysis_dataset.csv(1,576次住院发作,含结局及发作级危险因素);00_cleaning_log.json(数据清洗审计轨迹);code/(可复现所有报告数值的Python脚本);README.md(变量定义、去标识化声明、运行顺序及主要结果)。主要结果:首次MDRO检出时为感染(相对于定植)与院内死亡独立相关(校正Fine-Gray亚分布风险比2.62,95% CI 1.45-4.75,P = 0.001;病因特异性HR 2.23;logistic OR 2.72),粗估计值的衰减归因于ICU校正。

生态学分析涵盖2020年5月至2026年8月连续监测窗口(76个月)内的多样性、年际更替和季节性;病房级共检出网络为描述性分析。隐私保护:所有标识符均替换为按顺序分配的研究编码(patient_no、episode_id、specimen_no、record_id);数据集不包含姓名、国家/医院ID号、联系方式或自由文本标识符。源系统中的中文分类标签已翻译为英文。软件:Python 3.8.1,配合numpy、pandas、scipy和matplotlib;lifelines包仅用于独立交叉验证。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。