脓毒症相关肝肾损伤中的微生物组与肠道特征

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07735182

标准获取流程：

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数据说明

条件：脓毒症、脓毒症所致急性肾损伤、胃肠道微生物组、脓毒症相关肝损伤、重症医学。脓毒症是重症监护病房中发病和死亡的主要原因。脓毒症相关肝损伤（SALI）和脓毒症相关急性肾损伤（S-AKI）是常见的并发症，与不良临床结局相关。肠道微生物多样性改变、微生物代谢产物、肠道屏障功能障碍及全身性炎症可能促进脓毒症期间肝肾功能损伤。然而，SALI和S-AKI患者的前瞻性纵向证据仍然有限。这项前瞻性、多中心、纵向观察性队列研究将纳入来自六家医疗中心八个重症监护病房的成年脓毒症患者，以及健康成年志愿者作为基线参考队列。对于脓毒症患者，将在脓毒症诊断后第0天、第3-5天、第7-10天和第14-20天采集粪便和血液样本。健康志愿者将在入组时提供单次基线粪便和血液样本。

粪便微生物α多样性和群落结构将通过宏基因组测序和生物信息学分析进行评估。血浆代谢物，包括总短链脂肪酸、硫酸吲哚酚及其他靶向血浆代谢物，将通过超高效液相色谱-串联质谱法进行测定。肠道屏障和临床生物标志物也将被评估。主要目标是评估粪便微生物α多样性（以Shannon多样性指数衡量）的纵向轨迹与脓毒症诊断后7天内SALI和S-AKI发生之间的关联。次要目标包括评估粪便微生物β多样性的纵向变化与SALI和S-AKI发生之间的关联；评估发生SALI或S-AKI的患者中粪便微生物α多样性纵向轨迹与第14-20天器官恢复状态之间的关联；描述选定的血浆代谢物和肠道生物标志物浓度

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。