炎症性肠病患者肠道细菌产LPC与LPA的纵向研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06548399

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数据说明

疾病：炎症性肠病、克罗恩病、溃疡性结肠炎。人体内栖息着一个复杂的微生物群落，统称为“微生物群”。这些细菌绝大多数存在于胃肠道（结肠、小肠、胃和食道）的管腔中。多项证据表明，微生物群（细菌）的变化可能参与多种胃肠道疾病的发生，包括炎症性肠病（IBD），其主要分为两种类型：克罗恩病和溃疡性结肠炎。近期数据表明，肠道细菌能够产生溶血磷脂酰胆碱（LPC）及其衍生物溶血磷脂酸（LPA），这些小型脂质分子此前已被证明参与慢性疼痛的发生和维持。研究者发现，这些分子在炎症性肠病（IBD）患者粪便中含量较高，但目前尚不清楚：1）它们是否由肠道细菌产生；2）它们的产生是否是IBD患者慢性疼痛的根本原因。

本研究的目的是确定肠道细菌是否产生LPC和LPA，并诱发慢性腹痛，这种情况在许多IBD患者中很常见，即使其结肠炎处于缓解期（无明显肠道炎症）。在这项探索性纵向研究中，研究者将招募18至70岁、男女不限、有中度至重度慢性腹痛病史（由其胃肠病学家定义）的IBD患者，这些腹痛在结肠炎缓解期（CT或MRI成像无明显炎症，且基线粪便钙卫蛋白低于200 μg/g粪便）或仅有轻度肠道炎症（由结肠镜检查定义：内镜下Mayo评分为0-1分，或克罗恩病简化内镜评分为0-10分）时持续存在。我们将在筛选访视首次评估后，招募15名基线粪便LPC低于200 μg/mg且LPA低于100 μg/mg水平的患者。招募将在麦克马斯特大学进行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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