韩国肾脏生物样本库网络系统面向下一代分析

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03929887

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：肾小球疾病、微小病变型肾病、IgA肾病、膜性肾病、局灶节段性肾小球硬化、狼疮性肾炎、新月体性肾小球肾炎。肾小球肾炎（GN），如微小病变型肾病（MCD）、局灶节段性肾小球硬化（FSGS）、膜性肾病（MN）和免疫球蛋白A肾病（IgAN），其临床表现相当常见，常导致肾功能不全，给个人和社会带来巨大的经济负担。然而，治疗选择在很大程度上基于临床和病理参数，个体对治疗的反应或预后尚不确定。近年来，随着分子分析和计算生物信息学的进步，来自人类肾脏活检的基因组数据可为肾脏病学精准医学的未来提供坚实基础。为响应韩国卫生福利部关于建立临床研究登记处的申请要求，多所大学联合成立了韩国肾脏活检网络（KORNERSTONE）。

通过该协作网络，研究者希望了解肾小球肾炎的基础生物学机制，并旨在储存长期观察数据及相应的生物学数据，包括来自肾脏组织的基因组数据和数字化的肾脏病理数据。该数据库归档于一个基于网络的平台，以便于访问并进一步丰富研究者的资源。 ============ 1. 血液检查：全血细胞计数（CBC）、生化检查（钙、磷、葡萄糖、总蛋白、白蛋白、尿酸）、电解质、肾功能（血尿素氮、肌酐、估算肾小球滤过率）、肝功能（天冬氨酸氨基转移酶、丙氨酸氨基转移酶） 2. 免疫学血液检查：补体3、补体4、抗链球菌溶血素O（ASO）、类风湿因子（RF）、冷球蛋白、抗双链DNA抗体、抗核抗体（ANA） 3. 尿液检查：尿液分析、尿蛋白、尿白蛋白、尿肌酐 4. 放射学检查：肾脏超声、腹盆腔计算机断层扫描 5. 病理结果 6. 治疗信息：治疗状态、药物类型、治疗持续时间 7. 生活质量问卷：肾脏疾病与生活质量简表调查（成人）、PedsQL 4.0通用核心量表（儿科） 8. 饮食问卷

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。