艰难梭菌在人结肠类器官单层跨孔共培养系统中促进CCL20表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327570

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

致病性细菌艰难梭菌是抗生素相关性腹泻疾病的主要原因。该疾病的治疗具有挑战性，因为用于治疗的抗生素也可能延续了导致初始易感性的条件。阐明艰难梭菌与肠上皮相互作用的机制对于促进新治疗方案的开发是必要的。本文所述的研究展示了一种组织培养系统的开发，该系统支持艰难梭菌与由结肠类器官（源自人结肠活检的类器官）产生的人肠上皮模型共培养时的生长。上皮细胞对艰难梭菌的响应包括CCL20的上调，该基因编码一种趋化因子。细菌产生葡萄糖基化毒素是CCL20上调所必需的。此外，细菌以非毒素依赖的方式与单层细胞相关联。该系统将支持未来对CDI期间上皮/艰难梭菌相互作用的研究，以及鉴定驱动艰难梭菌在人肠道中致病机制的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。