人胰腺ε细胞基因特征
产生 ghrelin 的 ε 细胞是人胰岛中的第五种内分泌细胞类型。成人胰腺中 ε 细胞的丰度极低,这阻碍了对调控该细胞类型发育和功能的分子通路的研究

基本信息
资源简介
人胰腺ε细胞基因特征
该数据集名为 Gene signature of the human pancreatic ε-cell(人胰腺 ε 细胞的基因特征),聚焦于人胰岛中第五种内分泌细胞类型——产生 ghrelin 的 ε 细胞。由于成人胰腺中 ε 细胞丰度极低,长期以来对调控其发育与功能的分子通路研究受到阻碍。该研究利用单细胞 RNA 测序技术,对从成年非糖尿病供者中分离的胰腺 ε 细胞进行分子特征刻画,重点关注转录因子、细胞表面受体以及参与代谢通路并调控细胞功能的基因,同时呈现可将 ε 细胞与其他胰岛内分泌细胞类型区分开的基因。该数据集在站内归入消化系统疾病 / 其他分类,来源站为 search.dataone.org,采用 CC0 1.0 公有领域贡献许可。
【数据集背景】
人胰岛包含多种内分泌细胞类型,产生 ghrelin 的 ε 细胞是其中的第五种内分泌细胞类型。在成人胰腺中,ε 细胞的丰度极低,这一特点使得针对该细胞类型发育与功能的分子通路研究难以开展。既有知识对 ε 细胞功能相关基因的了解因此受限。该研究旨在通过单细胞层面的转录组分析,扩展对 ε 细胞发育过程中重要功能基因的认识,并为研究者提供一个可用于查询该细胞类型转录组的资源。
【数据内容】
数据集的核心内容是成年非糖尿病供者胰腺 ε 细胞的基因特征。研究聚焦于转录因子、细胞表面受体以及参与代谢通路的基因,这些基因共同参与细胞功能的调控。此外,数据中还呈现了能够将 ε 细胞与其他胰岛内分泌细胞类型区分开的基因集合。源站描述指出,该研究提供了 interrogate 该细胞类型转录组的资源,但未提供样本量、基因数量、测序深度等具体数值。
【采集与来源】
数据来源于 search.dataone.org。研究材料为从成年非糖尿病供者中分离的胰腺 ε 细胞,采用单细胞 RNA 测序技术获取分子特征。源站未提供供者数量、样本处理流程、测序平台型号等更细的采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于研究人胰腺 ε 细胞的分子特征,包括其转录因子调控、细胞表面受体特征以及代谢通路相关基因的表达情况;也适用于需要区分 ε 细胞与其他胰岛内分泌细胞类型的研究场景,例如细胞类型注释、标志基因筛选以及 ε 细胞发育与功能相关通路的探索。源站未提供其他具体应用案例。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据文件格式、下载方式、分析流程或配套代码等。
【质量与限制】
该数据集基于单细胞 RNA 测序技术,研究对象为成年非糖尿病供者的胰腺 ε 细胞。由于 ε 细胞在成人胰腺中丰度极低,相关研究长期受限,这一客观特点也意味着该资源所覆盖的细胞类型较为特殊。源站未提供数据质量评估指标、批次信息、验证实验结果或已知局限性说明。
【引用与许可】
该数据集采用 CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可。源站未提供具体的引用格式或推荐引用文献信息。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
产生胃饥饿素的ε细胞是人类胰岛中的第五种内分泌细胞类型。ε细胞在成人胰腺中的丰度极低,这阻碍了对其发育和功能调控分子通路的研究。在本研究中,我们利用单细胞RNA测序技术,探索了从成年非糖尿病供者中分离的胰腺ε细胞其功能相关的分子特征。我们重点关注转录因子、细胞表面受体以及参与代谢途径并有助于细胞功能调控的基因。此外,还展示了可将ε细胞与其他胰岛内分泌细胞类型区分开的基因。本研究拓展了先前关于ε细胞发育过程中功能重要基因的认识,并为研究这一罕见人类胰岛细胞类型的转录组提供了资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




