人胰腺ε细胞基因特征

产生 ghrelin 的 ε 细胞是人胰岛中的第五种内分泌细胞类型。成人胰腺中 ε 细胞的丰度极低,这阻碍了对调控该细胞类型发育和功能的分子通路的研究

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基因组分类胰腺ε细胞单细胞RNA测序胰岛内分泌细胞转录因子细胞表面受体代谢通路消化系统疾病
Gene signature of the human pancreatic ε-cell

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

人胰腺ε细胞基因特征

该数据集名为 Gene signature of the human pancreatic ε-cell(人胰腺 ε 细胞的基因特征),聚焦于人胰岛中第五种内分泌细胞类型——产生 ghrelin 的 ε 细胞。由于成人胰腺中 ε 细胞丰度极低,长期以来对调控其发育与功能的分子通路研究受到阻碍。该研究利用单细胞 RNA 测序技术,对从成年非糖尿病供者中分离的胰腺 ε 细胞进行分子特征刻画,重点关注转录因子、细胞表面受体以及参与代谢通路并调控细胞功能的基因,同时呈现可将 ε 细胞与其他胰岛内分泌细胞类型区分开的基因。该数据集在站内归入消化系统疾病 / 其他分类,来源站为 search.dataone.org,采用 CC0 1.0 公有领域贡献许可。

【数据集背景】

人胰岛包含多种内分泌细胞类型,产生 ghrelin 的 ε 细胞是其中的第五种内分泌细胞类型。在成人胰腺中,ε 细胞的丰度极低,这一特点使得针对该细胞类型发育与功能的分子通路研究难以开展。既有知识对 ε 细胞功能相关基因的了解因此受限。该研究旨在通过单细胞层面的转录组分析,扩展对 ε 细胞发育过程中重要功能基因的认识,并为研究者提供一个可用于查询该细胞类型转录组的资源。

【数据内容】

数据集的核心内容是成年非糖尿病供者胰腺 ε 细胞的基因特征。研究聚焦于转录因子、细胞表面受体以及参与代谢通路的基因,这些基因共同参与细胞功能的调控。此外,数据中还呈现了能够将 ε 细胞与其他胰岛内分泌细胞类型区分开的基因集合。源站描述指出,该研究提供了 interrogate 该细胞类型转录组的资源,但未提供样本量、基因数量、测序深度等具体数值。

【采集与来源】

数据来源于 search.dataone.org。研究材料为从成年非糖尿病供者中分离的胰腺 ε 细胞,采用单细胞 RNA 测序技术获取分子特征。源站未提供供者数量、样本处理流程、测序平台型号等更细的采集信息。

【适用场景】

该数据集适用于研究人胰腺 ε 细胞的分子特征,包括其转录因子调控、细胞表面受体特征以及代谢通路相关基因的表达情况;也适用于需要区分 ε 细胞与其他胰岛内分泌细胞类型的研究场景,例如细胞类型注释、标志基因筛选以及 ε 细胞发育与功能相关通路的探索。源站未提供其他具体应用案例。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据文件格式、下载方式、分析流程或配套代码等。

【质量与限制】

该数据集基于单细胞 RNA 测序技术,研究对象为成年非糖尿病供者的胰腺 ε 细胞。由于 ε 细胞在成人胰腺中丰度极低,相关研究长期受限,这一客观特点也意味着该资源所覆盖的细胞类型较为特殊。源站未提供数据质量评估指标、批次信息、验证实验结果或已知局限性说明。

【引用与许可】

该数据集采用 CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可。源站未提供具体的引用格式或推荐引用文献信息。

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A445ac97e724b63075207529bb6c81cd70424443796d31d8589a3aa899e006692

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

产生胃饥饿素的ε细胞是人类胰岛中的第五种内分泌细胞类型。ε细胞在成人胰腺中的丰度极低,这阻碍了对其发育和功能调控分子通路的研究。在本研究中,我们利用单细胞RNA测序技术,探索了从成年非糖尿病供者中分离的胰腺ε细胞其功能相关的分子特征。我们重点关注转录因子、细胞表面受体以及参与代谢途径并有助于细胞功能调控的基因。此外,还展示了可将ε细胞与其他胰岛内分泌细胞类型区分开的基因。本研究拓展了先前关于ε细胞发育过程中功能重要基因的认识,并为研究这一罕见人类胰岛细胞类型的转录组提供了资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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