台湾患者CMUH队列癌旁正常肝组织基因表达
该数据集来源于omicsdi.org,收录中国医药大学附设医院(CMUH)台湾患者队列的癌旁正常肝组织基因表达数据,主题标签为基因组学,本站归类为消化系统疾病/其他

基本信息
资源简介
台湾患者CMUH队列癌旁正常肝组织基因表达
该数据集为癌旁正常肝组织的基因表达数据,来源于中国医药大学附设医院(CMUH)台湾患者队列,英文名称为 Gene expression of adjacent normal liver tissue in China Medical University Hospital (CMUH) cohort of Taiwanese patients。数据经 omicsdi.org 收录,主题标签为基因组学,在分类体系中归入消化系统疾病 / 其他类别。其核心价值在于提供以台湾患者为背景的肝脏正常组织转录组层面的观测材料,可供研究者在比较肿瘤与癌旁组织、考察肝脏基因表达基线特征等工作中参考使用。以下依据可获得的信息,从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
肝组织基因表达研究通常需要对照材料,癌旁正常肝组织是肿瘤研究中常用的参照样本。该数据集聚焦于中国医药大学附设医院(CMUH)台湾患者队列的癌旁正常肝组织,属于基因组学主题下的表达谱类数据。其建立背景与消化系统疾病研究相关,在分类上被归入消化系统疾病 / 其他。数据来源站为 omicsdi.org,该站对数据集的描述与数据集英文名称一致,均指向同一批癌旁正常肝组织的基因表达信息。
【数据内容】
数据集的内容为癌旁正常肝组织的基因表达数据,样本背景为中国医药大学附设医院(CMUH)队列中的台湾患者。主题标签为基因组学,表明数据属于基因表达层面的观测记录。除上述范围界定外,源站未提供关于基因数量、样本数量、测序平台、表达定量单位、分组设计等具体内容信息。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org,原始出处为中国医药大学附设医院(CMUH)台湾患者队列。源站描述仅说明该数据为上述队列中癌旁正常肝组织的基因表达数据,未提供采样时间、采样医院科室、伦理审批、样本处理流程、测序或芯片平台等细节。因此,关于采集与来源的更详细信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容界定,该数据集可用于涉及肝脏正常组织基因表达基线的分析工作,例如作为癌旁对照材料参与肿瘤与正常组织之间的表达比较研究,或用于消化系统疾病相关基因组学研究的参考。由于主题标签为基因组学,也可在转录组层面的方法学验证或表达模式探索中作为候选数据资源。需要说明的是,上述场景为基于数据主题与样本类型的通用用途说明,源站未提供针对具体应用场景的验证结论或性能指标。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方式,包括下载途径、文件格式、数据组织方式、预处理步骤、标准化方法以及配套的分析工具或代码。使用者需依据 omicsdi.org 上该数据集的条目信息自行确认获取与使用条件。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量的信息,例如样本量、测序深度、数据完整性、批次效应评估或质控结果。该数据集仅覆盖癌旁正常肝组织,未说明是否包含肿瘤组织或其他对照类型;样本来自单一医院队列的台湾患者,源站未提供其人群代表性或外部验证情况。上述限制需在使用时加以考虑。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、文献出处、DOI 或版本信息,也未提供许可协议、使用条款或数据共享政策。使用者在引用或再利用前,应通过 omicsdi.org 对应条目核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1498489
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Gene expression of adjacent normal liver tissue in China Medical University Hospital (CMUH) cohort of Taiwanese patients
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。


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