转座子插入高通量测序数据：亚洲虎蚊向温带环境适应性进化

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.9p925

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数据集大小约 94.4 MB。

数据说明

入侵物种为评估局部适应在新环境定殖过程中的作用提供了独特的机会。在这些物种中，亚洲虎蚊——白纹伊蚊——是多种人类病毒性疾病（包括登革热和基孔肯雅热）的威胁性传播媒介，并引发了人们对寨卡热的担忧。其在温带和热带环境中的广泛存在一直被视为高度“生态可塑性”的体现。然而，尚无研究在分子水平上评估适应性进化在白纹伊蚊生态成功中的作用。在本研究中，我们对来自越南原生种群和欧洲温带入侵种群的140只野外采集蚊虫进行了基因组扫描，以寻找可能导致局部适应的潜在选择信号。对转座元件插入的高通量基因分型揭示了超过120，000个多态性位点，其中绝大多数显示生物地理区域之间几乎不存在结构。尽管如此，仍有92个离群位点显示出温带与热带种群之间的高度分化。

这些位点中的大多数在欧洲人群中以高插入频率分离，表明这一模式可能是温带地区近期适应性进化事件的结果。对重叠及邻近基因的分析凸显了若干候选基因，涉及滞育、脂质和保幼激素等通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。