腹泻猫粪便微生物组数据集
该数据集包含健康猫、急性腹泻猫和慢性腹泻猫的粪便样本,通过16S rRNA基因测序获得的微生物组数据,涵盖了细菌群落组成和预测的功能基因信息等生物学模态,主要用于研究猫腹泻疾病的微生物机制、比较不同健康状态下肠道菌群差异,并探索其在动物医学和微生物生态学中的应用价值。

基本信息
资源简介
腹泻猫粪便微生物组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The Fecal Microbiome in Cats with Diarrhea》。配套论文《The Fecal Microbiome in Cats with Diarrhea》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0127378。源站首次发布:2015-05-19。
【数据内容】
源站原始描述:Recent studies have revealed that microbes play an important role in the pathogenesis of gastrointestinal (GI) diseases in various animal species, but only limited data is available about the microbiome in cats with GI disease. The aim of this study was to evaluate the fecal microbiome in cats with diarrhea. Fecal samples were obtained from healthy cats (n = 21) and cats with acute (n = 19) or chronic diarrhea (n = 29) and analyzed by sequencing of 16S rRNA genes, and PICRUSt was used to predict…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个,合计 148.15 KB。S1_Table.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,49.66 KB。S2_Table.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,98.49 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0127378。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences、Ecology。主题标签:animal species、Fecal Microbiome、order Burkholderiales、effect size、genera Megamonas、GI disease、aldarate metabolism、diarrheic cats、lda、families Enterobacteriaceae。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences、Ecology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_The_Fecal_Microbiome_in_Cats_with_Diarrhea_/1419857
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Suchodolski, Jan S.; L. Foster, Mary; U. Sohail, Muhammad; Leutenegger, Christian; V. Queen, Erica; M. Steiner, Jörg; et al. (2016). The Fecal Microbiome in Cats with Diarrhea. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/_The_Fecal_Microbiome_in_Cats_with_Diarrhea_/1419857
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数据说明
该数据集是一个动物医学研究数据集,旨在研究腹泻猫的粪便微生物组特征。数据集包含来自健康猫(21只)、急性腹泻猫(19只)和慢性腹泻猫(29只)的粪便样本,通过16S rRNA基因测序分析微生物组成,并利用PICRUSt工具预测微生物组的功能基因含量。研究采用线性判别分析效应大小(LEfSe)方法,揭示了健康猫与腹泻猫之间细菌群落的显著差异,例如腹泻猫中肠杆菌科、链球菌属等显著增加,而健康猫中拟杆菌科、罗斯氏菌属等更丰富。数据集可用于探索猫胃肠道疾病的微生物致病机制、寻找潜在生物标志物,并支持动物肠道微生物组与健康关系的研究。
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