基于免疫细胞类型和基因表达的无监督聚类揭示胆道闭锁的不同亚型
该数据集是一个基因表达数据集，包含来自胆道闭锁患者的微阵列基因表达数据，数据模态为基因表达谱。通过无监督聚类方法，该数据集将患者划分为三个亚型（自身免疫型、病毒型和胚胎型），并进行了功能富集和枢纽基因分析，主要用于研究胆道闭锁的发病机制、亚型分类以及潜在治疗靶点的探索。
基本信息
资源简介
基于免疫细胞类型和基因表达的无监督聚类揭示胆道闭锁的不同亚型
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Table_3_Unsupervised Clustering Reveals Distinct Subtypes of Biliary Atresia Based on Immune Cell Types and Gene Expression.xlsx》。配套论文《Liver Immune Profiling Reveals Pathogenesis and Therapeutics for Biliary Atresia》发表于 Cell（2020），DOI：10.1016/j.cell.2020.10.048。源站首次发布：2021-09-27。
【数据内容】
源站原始描述：BackgroundBiliary atresia (BA) is a severe cholangiopathy of early infancy that destroys cholangiocytes, obstructs ductular pathways and if left untreated, culminates to liver cirrhosis. Mechanisms underlying the etiological heterogeneity remain elusive and few studies have attempted phenotyping BA. We applied machine learning to identify distinct subtypes of BA which correlate with the underlying pathogenesis. MethodsThe BA microarray dataset GSE46995 was downloaded from the Gene Expression Omn…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 11.64 KB。Table_3_Unsupervised Clustering Reveals Distinct Subtypes of Biliary Atresia Based on Immune Cell Types and Gene Expression.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，11.64 KB。数据集 DOI：10.3389/fimmu.2021.720841.s004。
【主题与分类】
源站学科分类：Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。主题标签：autoimmune、perinatal infection、biliary atresia、immune cells and genes、unsupervised hierarchical clustering。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_3_Unsupervised_Clustering_Reveals_Distinct_Subtypes_of_Biliary_Atresia_Based_on_Immune_Cell_Types_and_Gene_Expression_xlsx/16683517
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Pang, Xiuqing; Cao, Jing; Chen, Shuru; Gao, Zhiliang; Liu, Guangjian; Chong, Yutian; et al. (2021). Table_3_Unsupervised Clustering Reveals Distinct Subtypes of Biliary Atresia Based on Immune Cell Types and Gene Expression.xlsx. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个基因表达数据集，旨在研究胆道闭锁（Biliary atresia, BA）的异质性。数据集来源于公共基因表达数据库GEO中的微阵列数据GSE46995，通过无监督层次聚类分析将胆道闭锁患者分为三个不同的亚型：自身免疫型、病毒型和胚胎型。研究进一步通过功能富集分析和枢纽基因鉴定探索了各亚型相关的分子机制，并在独立数据集GSE15235中进行了验证。该数据集主要用于胆道闭锁的亚型分类、发病机制探索以及相关生物标志物的发现，为精准医疗和疾病机制研究提供支持。
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