PRJNA616451:Homo sapiens 转录组(miRNA)
源站描述显示,研究目的是确定贲门失弛缓症患者中失调 miRNA 的一些模式,采用匹配的病例对照设计,在德黑兰 Shariati 医院纳入 52 例贲门失弛缓症患者和 50 例非贲门失弛缓症对照

基本信息
资源简介
PRJNA616451:Homo sapiens 转录组(miRNA)
PRJNA616451 是一个以人类转录组 miRNA 为研究对象的公开数据集,收录于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),在分类上归入消化系统疾病中的贲门失弛缓症方向。该数据集围绕贲门失弛缓症患者中 miRNA 失调模式展开,采用匹配的病例对照研究设计,研究现场为德黑兰的 Shariati 医院,共纳入 52 例贲门失弛缓症患者与 50 例非贲门失弛缓症对照。数据集的主题标签为转录组或基因表达,整体定位是服务于贲门失弛缓症相关 miRNA 表达谱的检索、比较与二次分析,为探索该疾病的分子层面改变提供可公开获取的数据基础。
【数据集背景】
贲门失弛缓症属于消化系统疾病,其分子层面的改变是相关研究关注的方向之一。该数据集所对应的研究,目的正是确定贲门失弛缓症患者中失调 miRNA 的一些模式,即通过转录组层面的 miRNA 表达信息,观察患者与对照之间可能存在的表达差异格局。研究以匹配的病例对照设计组织样本,使病例组与对照组在纳入时具备可比性,从而支撑组间 miRNA 失调模式的比较分析。数据集以人类转录组 miRNA 为主题内容,主题标签标注为转录组或基因表达,说明其数据核心是基因表达层面的测量结果,而非基因组变异或临床随访记录。
【数据内容】
该数据集的内容属于人类转录组 miRNA 数据,主题标签为转录组或基因表达。其研究材料来自贲门失弛缓症患者与非贲门失弛缓症对照两类人群,样本规模分别为 52 例和 50 例。数据所承载的信息用于反映两组之间 miRNA 的表达情况,以支持对失调 miRNA 模式的判定。关于数据的具体文件构成、测序平台、reads 数量、表达矩阵格式、样本元数据字段等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。研究在德黑兰的 Shariati 医院开展,采用匹配的病例对照设计,纳入 52 例贲门失弛缓症患者和 50 例非贲门失弛缓症对照。该设计意味着病例与对照在纳入时经过匹配处理,以降低混杂因素对组间比较的影响。关于样本采集的具体时间范围、伦理审批信息、样本处理与测序流程等技术细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于贲门失弛缓症相关 miRNA 失调模式的检索与比较研究,可用于了解患者与对照之间 miRNA 表达差异的整体格局,也可作为消化系统疾病转录组研究中的参考数据之一。对于关注基因表达调控与疾病分子机制的研究者,该数据集提供了以病例对照方式组织的 miRNA 表达信息,便于开展差异表达层面的探索性分析。关于该数据集在其他疾病或更广泛人群中的外推适用性,源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时,可依据其病例对照结构,将 52 例贲门失弛缓症患者与 50 例非贲门失弛缓症对照分为两组,围绕 miRNA 表达信息开展组间比较,以识别失调 miRNA 的模式。由于数据集主题为转录组或基因表达,分析思路通常落在表达差异的观察与描述层面。关于数据下载方式、文件命名规则、预处理步骤与分析流程建议,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集采用匹配的病例对照设计,样本量为 52 例患者与 50 例对照,研究现场为德黑兰的 Shariati 医院,这些信息构成了理解其研究设计与样本规模的基础。需要说明的是,关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应处理、测序深度与覆盖度等技术质量信息,源站未提供;关于结果的验证方式与重复实验情况,源站未提供。因此在使用时应结合自身分析目的谨慎解读。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 PRJNA616451: Homo sapiens Transcriptome (miRNA)。关于数据的使用许可、引用格式与授权条款,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA616451
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在确定贲门失弛缓症患者中一些失调miRNA的模式。这项匹配的病例对照研究在德黑兰Shariati医院对52名贲门失弛缓症患者和50名非贲门失弛缓症对照者进行了研究。
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